Équipe

ALGLAVE Baptiste

Post doctorant(e)
Thématique(s) :
Dynamique spatiale, connectivité, habitats et zones fonctionnelles

Mots-clés : Aire de répartition géographique / Cycle de vie / Ecologie spatiale / Habitats essentiels / Engins de pêche / Flotilles / Poissons / Développement de scripts / Modélisation statistique / Statistiques multivariées

Projets en cours

Projets archivés

Mesures de gestion et espèces ACCessOires dans les pêcheries démersales du golfe de Gascogne

MACCO

Période : 2019 - 2023
Mots-clés : Dynamique des populations / Ecologie spatiale / Gestion intégrée / Habitats essentiels / Migration / Sélectivité des captures / Socio-écosystèmes / Usages / Ecosystèmes / Flotilles / Pêche / Développement de scripts / Modélisation individu-centrée / Modélisation mécaniste / Sciences participatives / Statistiques multivariées

Modélisation spatio-temporelle des zones fonctionnelles halieutiques par combinaison des données de captures à échelle fine des navires de pêche et des navires de recherche halieutique

FishMap

Période : 2020 - 2022
Mots-clés : Modèle de distribution d’espèce, SDM, modèles intégrés, modèles spatio-temporels, données VMS, échantillonnage préférentiel, TMB, INLA

Publications

Sélection de publications

Szuwalski Cody, Alglave Baptiste, Balstad Laurinne, Olmos Maxime, Punt André, Richar Jon, Stockhausen William, Veron Matthieu (2026). Density dependence modulates climate change impacts on eastern Bering Sea snow crab. Journal of Applied Ecology, 2026, 63 (3), pp.e70316. ⟨10.1111/1365-2664.70316⟩

Bocher Erwan, Bernard Jérémy, Le Saux Elisabeth, Gousseff Matthieu, Leconte François, Alglave Baptiste, Pic Jessica (2025). GeoClimate workshop: an open-source GIS toolbox suitable for urban climate studies. 12th International Conference on Urban Climate, Jul 2025, Rotterdam (NL), Netherlands

Michel Mathilde, Alglave Baptiste, Olmos Maxime, Torterotot Maëlle, Virgili Auriane, Martin-Marin Salomé, Royer Jean-Yves, Samaran Flore (2025). Modelling the influence of environmental factors on the acoustic presence of blue whale populations in the southern Indian Ocean. Scientific Reports, 2025, 15 (1), 23218 (16 p.). ⟨10.1038/s41598-025-02941-9⟩

Alglave Baptiste, Mourguiart Bastien, Kristensen Kasper, Rivot Etienne, Woillez Mathieu, Vermard Youen, Etienne Marie-Pierre (2025). Change of support for zero-inflated data: deriving fine-scale species distribution inferences from spatially aggregated data. Journal of the Royal Statistical Society: Series C Applied Statistics, 2025, ⟨10.1093/jrsssc/qlaf056⟩

Rovellini Alberto, Punt André, Bryan Meaghan, Kaplan Isaac, Dorn Martin, Aydin Kerim, Fulton Elizabeth, Alglave Baptiste, Baker Matthew, Carroll Gemma, Ferriss Bridget, Haltuch Melissa, Hayes Adam, Hermann Albert, Hernvann Pierre-Yves, Holsman Kirstin, Liu Owen, Mchuron Elizabeth, Morzaria-Luna Hem, Moss Jamal, Surma Szymon, Weise Madison (2024). Linking climate stressors to ecological processes in ecosystem models, with a case study from the Gulf of Alaska. ICES Journal of Marine Science, 2024, pp.1-13. ⟨10.1093/icesjms/fsae002⟩

Alglave Baptiste, Olmos Maxime, Casemajor Juliette, Etienne Marie-Pierre, Rivot Etienne, Woillez Mathieu, Vermard Youen (2024). Investigating fish reproduction phenology and essential habitats by identifying the main spatio-temporal patterns of fish distribution. ICES Journal of Marine Science, In press, ⟨10.1093/icesjms/fsae099⟩

Alglave Baptiste, Mourguiart Bastien, Kristensen Kasper, Rivot Etienne, Woillez Mathieu, Vermard Youen, Etienne Marie-Pierre (2024). Change of support for heavy-tailed zero inflated data: application to spatially aggregated ecological data for fine-scale species distribution inference. 2024

Olmos Maxime, Cao Jie, Thorson James, Punt André, Monnahan Cole, Alglave Baptiste, Szuwalski Cody (2023). A step towards the integration of spatial dynamics in population dynamics models: Eastern Bering Sea snow crab as a case study. Ecological Modelling, 2023, 485, pp.110484. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2023.110484⟩

Alglave Baptiste, Vermard Youen, Rivot Etienne, Etienne Marie-Pierre, Woillez Mathieu (2023). Identifying mature fish aggregation areas during spawning season by combining catch declarations and scientific survey data. Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences, 2023, ⟨10.1139/cjfas-2022-0110⟩

Alglave Baptiste (2022). Inferring fish spatio-temporal distribution and identifying essential habitats : tackling the challenge of preferential sampling and change of support to integrate heterogeneous data sources. Sciences and technics of fishery. Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement, 2022. English. ⟨NNT : 2022AGROH117⟩

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