DANET Alain
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Chargé de recherche Thématique(s) : Dynamique spatiale, connectivité, habitats et zones fonctionnelles
Interactions trophiques
Pressions multiples, impacts et évaluation de l’état écologique
Aide à la décision pour la conservation, la restauration et la gestion durable des écosystèmes
Adresse : UMR DECOD, 65 rue de Saint-Brieuc, Bât. 15, CS 84215, 35042 Rennes Cedex, France Mots-clés : cascades trophiques / Connectivité / Inférence de réseaux / Interactions trophiques / Réseaux d’interaction / Communautés / Ecosystèmes / Eutrophisation / Méta-communautés / Méta-écosystèmes / Plantes / Poissons / Analyses de séries temporelles / Développement de scripts / Modèles de réseaux / Modélisation mécaniste / Modélisation statistique  |
Objectifs de Recherche
Mes recherches visent à comprendre comment les pressions anthropiques modifient les communautés écologiques et perturbent le fonctionnement des écosystèmes. Cette question est complexe car les réponses des communautés émergent à la fois de la diversité des réactions spécifiques des espèces aux changements environnementaux et des réseaux d’interactions entre espèces. Mon travail intègre ces réseaux d’interactions dans des cadres théoriques et appliqués pour répondre à une question centrale : Comment les interactions entre espèces modulent-elles les effets des pressions environnementales sur les systèmes écologiques, notamment l’assemblage des communautés, le fonctionnement des écosystèmes et leur stabilité ?
Pour y parvenir, j’utilise une approche pluridisciplinaire combinant expérimentations, analyses de grandes bases de données et modélisation théorique, appliquée à divers systèmes (ex. zones arides et écosystèmes d’eau douce).
À DECOD, mon objectif est de contribuer à élucider l’influence des dynamiques spatiales sur la biodiversité, le fonctionnement et la stabilité des écosystèmes à grande échelle. Plus précisément, je cherche à :
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Évaluer empiriquement et théoriquement comment les flux d’espèces et de matière recomposent la structure des réseaux trophiques, avec des effets en retour sur les écosystèmes connectés spatialement (i.e., méta-écosystèmes).
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Intégrer ces mécanismes dans des modèles spatiaux explicites de méta-écosystèmes pour concevoir des stratégies innovantes de gestion et de restauration.
J’applique ce cadre au continuum terre-mer (écosystèmes terrestres, d’eaux douces et marins), en m’appuyant sur l’expertise collective de DECOD. Mon ambition à long terme est une intégration holistique de ce continuum via :
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L’analyse de grandes bases de données écologiques,
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Le développement de modèles théoriques,
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L’application à des systèmes expérimentaux et observationnels (ex-situ et in-situ) à l’UMR DECOD.
Conseil et expertise
Société Française d’Écologie et d’Évolution (SFE2)
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Membre du conseil d’administration (depuis 2021) : Secrétaire (2021–2025) et Vice-Trésorier (à partir de 2025).
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Groupe Thématique : Contribution active à "Agir face à la crise écologique".
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Interface Science-Politique
- Relecteur pour le Rapport IPCC 2021 (biodiversité & services écosystémiques)
- Conseiller scientifique pour l’ouvrage "La loi de l’entraide". -
Évaluation et Financements
- Relecteur pour les prix et bourses de la SFE2, dont le Prix Jeune Écologue et les Bourses de Terrain (depuis 2021). -
Enseignement et Science Ouverte
- Promotion des outils reproductibles : Formation à Git, compendiums R, pipelines, et Julia
Publications
Sélection de publications
Roemer Charlotte, Fromont Céline, Barot Sébastien, Couvet Denis, Danet Alain, Martin Jean-Louis, Navas Marie-Laure, Matutini Florence, Monnet Anne-Christine (2025). Pressured researchers in ecology and conservation demand support to guarantee fair interactions with stakeholders. Biological Conservation, 2025, 310, pp.111324. ⟨10.1016/j.biocon.2025.111324⟩
Lajaaiti Ismaël, Bonnici Iago, Kéfi Sonia, Mayall Hana, Danet Alain, Beckerman Andrew, Malpas Thomas, Delmas Eva (2025). EcologicalNetworksDynamics.jl: A Julia package to simulate the temporal dynamics of complex ecological networks. Methods in Ecology and Evolution, 2025, 16 (3), pp.520-529. ⟨10.1111/2041-210X.14497⟩
Danet Alain, Kéfi Sonia, Johnson Thomas, Beckerman Andrew (2025). Response diversity is a major driver of temporal stability in complex food webs. Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 2025, 292 (2058), ⟨10.1098/rspb.2025.0730⟩
Lajaaiti Ismaël, Bonnici Iago, Kéfi Sonia, Mayall Hana, Danet Alain, Beckerman Andrew, Malpas Thomas, Delmas Eva (2024). EcologicalNetworksDynamics.jl A Julia package to simulate the temporal dynamics of complex ecological networks. 2024
Lajaaiti Ismaël, Bonnici Iago, Kéfi Sonia, Mayall Hana, Danet Alain, Beckerman Andrew, Malpas Thomas, Delmas Eva (2024). EcologicalNetworksDynamics.jlA Julia package to simulate the temporal dynamics of complex ecological networks. 2024, ⟨swh:1:dir:d2734fcc52ebd24cd81cfca33dd2929d91aebcd9;origin=https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-04623870;visit=swh:1:snp:ca85589402311199e17dc9de31c5f45c61829868;anchor=swh:1:rel:dcbdd5bc275519771811f18fdd76dfff23355b81;path=/⟩
Danet Alain, Bautista Susana, Génin Alexandre, Beckerman Andrew, Anthelme Fabien, Kéfi Sonia (2024). Species diversity promotes facilitation under stressful conditions. Oikos, 2024, 2024 (9), pp.e10303. ⟨10.1111/oik.10303⟩
Bonnaffé Willem, Danet Alain, Leclerc Camille, Frossard Victor, Edeline Eric, Sentis Arnaud (2024). The interaction between warming and enrichment accelerates food‐web simplification in freshwater systems. Ecology Letters, 2024, 27 (8), pp.e14480. ⟨10.1111/ele.14480⟩
Boyd Robin, Powney Gary, Burns Fiona, Danet Alain, Duchenne François, Grainger Matthew, Jarvis Susan, Martin Gabrielle, Nilsen Erlend, Porcher Emmanuelle, Stewart Gavin, Wilson Oliver, Pescott Oliver (2022). ROBITT: a tool for assessing the risk-of-bias in studies of temporal trends in ecology. Methods in Ecology and Evolution, 2022, 13 (7), pp.1497-1507. ⟨10.1111/2041-210X.13857⟩