La semaine prochaine, nous aurons l’occasion d’assister à deux DECODages. Le premier sera mené par Oscar Gagiotti (prof. University of Saint Andrews) le Lundi 19 Juin entre 11h et 12h !
Oscar vient dans le cadre de la soutenance de l’HDR d’Erwan Quéméré (CR DECOD/INRAE ; même jour à 14h) et nous parlera d’apprentissage profond et de génétique.
La présentation sera en Anglais, plus de détails ci-dessous (sur la présentation d’Oscar et sur le second DECODage)!
Oscar vient dans le cadre de la soutenance de l’HDR d’Erwan Quéméré (CR DECOD/INRAE ; même jour à 14h) et nous parlera d’apprentissage profond et de génétique.
La présentation sera en Anglais, plus de détails ci-dessous (sur la présentation d’Oscar et sur le second DECODage)!
Deep Learning in population Genetics
Résumé
Big data and artificial intelligence are buzzwords that pervade most scientific fields and society in general, but the extent to which AI methods are being used to analyse big data varies greatly across scientific domains. Although many life-science disciplines have quickly embraced DL approaches, evolutionary biology has lagged behind because of its very strong preference for model-based approaches derived from the rich body of population genetics theory. This reticence is further enhanced by the reputation of DL as black-box models that cannot provide mechanistic explanations for the extremely accurate predictions they provide. However, this last roadblock is being removed by recent advances in “interpretable machine learning” algorithms. In this talk I will present two examples of deep learning applications that implement algorithms aimed at identifying the input variables that contribute the most to predictive power and, in doing so, allow us to make inferences about the mechanisms underlying observed patterns of genetic diversity.
Pour ceux qui veulent assister au séminaire en présentiel :
- Brest : salle Emile Postel
- Lorient : l’Amphi
- Nantes : entièrement en visio
- Rennes : Amphi Roux
Ce séminaire sera également accessible en distanciel sur Zoom.
Pour ceux qui ne peuvent pas assister aux DECODages, nous pouvons enregistrer les présentations sur demande, merci de nous prévenir en avance.
- 22/06/2023 : Angélica González (Rutgers University) => DECODage exceptionnel jeudi à 11h : Titre : Trait-based approaches and a stoichiometric view of the ecological nich
- 29/06/2023 : Stéphane Chantepie (postdoc DECOD)