FABRI-RUIZ Salomé
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Chercheur(e) Thématique(s) : Dynamique spatiale, connectivité, habitats et zones fonctionnelles
Pressions multiples, impacts et évaluation de l’état écologique
Adresse : IFREMER Mots-clés : Aire de répartition géographique / Ecologie spatiale / Epigénétique / Habitats essentiels / Multi-stress / Niche écologique / Stress abiotique / Stress biotique / Traits d’histoire de vie / Allocation d’énergie / Changement climatique / Communautés / Pêche / Poissons / Populations / ADNe / Développement de scripts / Modélisation individu-centrée / Modélisation mécaniste / Modélisation statistique / Statistiques multivariées  |
Mes travaux de recherche visent à mieux comprendre les facteurs qui contraignent la distribution des espèces marines, ainsi qu’à quantifier les impacts de pressions anthropiques multiples sur les écosystèmes marins, telles que le changement climatique, les énergies marines renouvelables, la pêche ou encore l’exploitation des ressources marines.
Pour cela, je développe et mobilise différentes approches numériques, à la fois statistiques, modèles de niche écologique, modèles de communautés, CKMR et mécanistiques (Dynamic Energy Budget). Je contribue également au développement d’indicateurs, tels que l’ELFI-C, permettant d’évaluer l’état des écosystèmes côtiers (projet NOURPIE).
Je m’intéresse par ailleurs au développement d’approches moléculaires, en particulier épigénétiques, afin d’estimer l’âge biologique et chronologique d’espèces de raies et de poissons. Ces approches sont combinées à des marqueurs physiologiques dans le but de mieux quantifier leur état de stress (projet AGEPPOP).
Enfin, je participe au déploiement de méthodes d’échantillonnage d’ADN environnemental (projet EMOI, Hinsight).
Projets en cours
Protocoles standards pour le suivi environnemental des parcs éoliens en mer | Période : 2026 - 2029 Mots-clés : Ecologie spatiale / Empreinte environnementale / Evaluation / Socio-écosystèmes / Usages / Communautés / Ecosystèmes / Macroinvertébrés / Phytoplankton / Poissons / Politiques publiques / Zoobenthos / Zooplancton / Analyses de séries temporelles / Capture, échantillonnage et inventaire / Hydroacoustique / Identification taxonomique / Imagerie / Modélisation statistique / Statistiques multivariées / Télédétection |
Approche génétique et physiologique pour quantifier l’état de santé des populations de Raies | Période : 2023 - 2026 Mots-clés : Dynamique des populations / Epigénétique / Multi-stress / Individus / Pêche / Poissons / Populations / Bio-informatique / Biomarqueurs et traceurs / Capture, échantillonnage et inventaire / Développement de scripts / Géomatique / Marquage-recapture / Modélisation statistique |
Mise à jour de la base de données NourPress afin de calculer l’Indicateur ELFI-C en Manche et en Atlantique. | Période : 2024 - 2026 Mots-clés : Epigénétique / Habitats essentiels / Usages / Communautés / Poissons / Politiques publiques / Populations / Analyses de séries temporelles / Développement de scripts / Modélisation statistique / Statistiques multivariées |
Suivi des nourriceries côtières du parc naturel marin EGMP : Interprétation et analyse | Période : 2023 - 2025 Mots-clés : Aire de répartition géographique / Cycle de vie / Ecologie spatiale / Habitats essentiels / Communautés / Poissons / Politiques publiques / Analyses de séries temporelles / Capture, échantillonnage et inventaire / Développement de scripts / Modélisation statistique |
Je suis impliquée dans l’appui aux politiques publiques, notamment à travers la définition de protocoles standarts de suivi environnemental des parcs éoliens en mer, l’expertise des suivis réalisés sur ces parcs pour le compartiment poisson, ainsi que l’évaluation des suivis environnementaux liés à l’exploitation des granulats marins.
Publications
Sélection de publications
Posa Luca, Buton Angelique J., Khasnavis Anita M., Miracle Sophia A., Albers Kathryn M., Fanelli Matthew J., Le Timmy, Gamble Mackenzie, McDonald Ashley K., Martin Gilles, Fabri-Ruiz Salome, Freyberg Zachary, Logan Ryan W., Puig Stephanie (2026). Keratinocytes and PDGF-B/PDGFRβ signaling modulate peripheral opioid tolerance . Iscience , 29(7), 116634 (24p.) . https://doi.org/10.1016/j.isci.2026.116634 . https://archimer.ifremer.fr/doc/01071/118258/
Brosset Pablo, Jamme Tino, Sadoul Bastien, Vlach Manuel, Lorance Pascal, Rioux Vincent, Fabri‐ruiz Salome (2026). Fatty acid profiles of muscle and liver reveal ontogenetic shifts in diet and reproductive investment in an undulate ray from the Bay of Biscay (northeast Atlantic) . Journal Of Fish Biology , 109(1), 189-200 . https://doi.org/10.1111/jfb.70376
Bernard Guillaume, Buchet Rémi, Cuif Marion (coord.), Fabri-Ruiz Salome, Menet Florence, Robert Alexandre, Romagnan Jean-Baptiste (2026). Rapport d’expertise sur les protocoles (V2) pour l’état initial de l’environnement de la zone « Golfe de Gascogne Sud » (AO10 - GGS) . Direction Générale de l’Énergie et du Climat (DGEC), Paris-La Défense , Ref. DGD-S/26041 , 9p. https://archimer.ifremer.fr/doc/01071/118276/
Bernard Guillaume, Buchet Rémi, Cuif Marion (coord.), Fabri-Ruiz Salome, Romagnan Jean-Baptiste (2026). Rapport d’expertise de l’Ifremer sur la synthèse bibliographique (V1) pour l’état initial de l’environnement de la zone « Golfe de Gascogne Sud » (AO10 - GGS) . Direction Générale de l’Énergie et du Climat (DGEC), Paris-La Défense , Ref. DGD-S/26021 , 12p. https://archimer.ifremer.fr/doc/01071/118275/
Lespagnol Pierre, Lame Alicia, Fabri-Ruiz Salome, Delaunay Damien, Régimbart Amélie, Brind'Amour Anik (2026). Toward a population-based assessment of ecological status: methodological considerations based on the ELFI-C multi-metric index . Isobay 19 - The 19th International Symposium on Oceanography of the Bay of Biscay. June 16-18 2026, Donostia-San Sebastian .
Lame Alicia, Fabri-Ruiz Salome, Delaunay Damien, Mauffret Aourell, Brun Mélanie, Régimbart Amélie, Brind'Amour Anik (2026). Mapping Pressures on Coastal Fish Nurseries in the Bay of Biscay . Isobay 19 - The 19th International Symposium on Oceanography of the Bay of Biscay. June 16-18 2026, Donostia-San Sebastian .
Cuif Marion, Doray Mathieu, Fabri-Ruiz Salome, Loots Christophe (2026). Rapport d’expertise de l’Ifremer sur les protocoles (V1) pour l’état initial de l’environnement de la zone « Golfe de Gascogne Sud » (AO10 - GGS) . Direction Générale de l’Energie et du Climat (DGEC) , Ref. DGD-S/26011 , 8p. https://archimer.ifremer.fr/doc/01013/112446/
Lehmann Jeremie, Normand Julien, Lefebvre Alain, Hernandez Farinas Tania, Mertens Kenneth, Terre Terrillon Aouregan, Bilien Gwenael, Francoise Sylvaine, Soudant Dominique, Huguet Antoine, Rebout-Delpuech Colas, Amouroux Isabelle, Buchet Rémi, Herlory Olivier, Le Bourhis Enored, Brach-Papa Christophe, Dufois Francois, Woillez Mathieu, Fabri-Ruiz Salome, Dubroca Laurent, Germain Gregory, Bothorel Pierre, Ponte Aurelien, Mopin Irene, Touzeau Alexandra, Quimbert Erwann, Devreker David, Wacquet Guillaume, Navon Maxime (2026). Projet EMOI. Effets de l'Eolien en Mer sur les écosystèmes marins pélagiques, vers une Observation Intégrée . Livrable intermédiaire. RST ODE/COAST/LERN/26-04 . https://archimer.ifremer.fr/doc/01007/111911/
ICES (2025). Working Group on Cumulative Effects Assessment Approaches in Management (WGCEAM; outputs from 2024 meeting) . ICES Scientific Reports/Rapports scientifiques du CIEM , 7(16), 51pp. https://doi.org/10.17895/ices.pub.28322693 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00935/104704/
ICES (2025). Working Group on Cumulative Effects Assessment Approaches in Management (WGCEAM; outputs from 2024 meeting) . ICES Scientific Reports/Rapports scientifiques du CIEM , 7(16), 51pp. Publisher's official version : https://doi.org/10.17895/ices.pub.28322693 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00935/104704/