M&M
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Mésocosmes et Macrodurée : mieux prédire le succès et les impacts des invasion biologiques |
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Recherche
Les invasions biologiques détruisent la biodiversité et engendrent des coûts économiques importants. Afin d’améliorer notre capacité à prédire les invasions biologiques et leurs impacts sur les écosystèmes, DECOD a lancé le projet mésocosmes et macrodurée (M&M).
M&M combine la compilation de réseaux trophiques publiés dans la littérature scientifique avec une expérimentation à long terme (2020-présent) dans 12 mésocosmes aquatiques afin de simuler une invasion par l’écrevisse de Louisiane (<i>Procambarus clarkii<i>), une espèce mondialement invasive. L’expérimentation se déroule sur la plateforme expérimentale PEARL de l’U3E (INRAE, Rennes). Quatre mésocosmes servent de témoins non envahis, quatre contiennent des écrevisses, et quatre contiennent des écrevisses soumises à une exploitation qui simule une gestion par tentative d’éradication, la mesure de mitigation la plus communément employée. En dehors de cette exploitation, les mésocosmes ne subissent aucune autre manipulation et se comportent comme des mares naturelles dans lesquelles toutes les populations animales et végétales se maintiennent naturellement.
Depuis 2021, des suivis permettent d’enregistrer les paramètres physiques et chimiques de l’eau, ainsi que la composition des communautés biologiques en se basant sur des méthodes combinant des sondes multiparamètres, des photographies aériennes, des échantillonnages <i>in situ<i>, et des approches d’analyse d’image par deep-learning ayant fait l’objet d’avancées technologiques (Jaballah et al. 2023; Walter et al. In press).
M&M est porté par 10 personnels permanents de DECOD Rennes, fait l’objet de deux collaborations avec l’Université de Rennes et de plusieurs collaborations internationales, est inscrit dans le projet ANR BackOut (2026-2029), et supporte les thèses en cours d’Emilien Gaigné (2024-2027) et de Mingjun Feng (2024-2028).
Références :
- ADDIN ZOTERO_BIBL CSL_BIBLIOGRAPHY Jaballah S, Garcia GF, Martignac F, et al (2023) A deep learning approach to detect and identify live freshwater macroinvertebrates. Aquatic Ecology. https://doi.org/10.1007/s10452-023-10053-7
- Walter H, Gorzerino C, Collinet M, et al (In press) PlanktonFlow : hands-on deep-learning classification of plankton images for biologists. PCI Ecology. https://doi.org/10.1101/2025.09.19.677346
Partenaires scientifiques
- INRAE U3E (Unité Expérimentale d'Ecologie et d'Ecotoxicologie Aquatiques), Rennes, France
- UMR ECOBIO (Ecosystèmes, Biodiversité et Evolution), CNRS, Université Rennes 1, Rennes
- UMR BioSP (Biostatistique et processus SPatiaux), INRAE, Avignon, France
- UMR EGCE (évolution, génomes, comportement et écologie), CNRS, Université Paris-Saclay, France
- CEES (Center for an Ecological and Evolutionary Synthesis), Université d’Oslo, Norvège
- Université d’Oxford, Oxford, Grande Bretagne
- Department of Ichthyology & Aquatic Environment, Université de Thessalie, Grèce
- Institut d’écologie aquatique, Centre de recherche en écologie, Budapest, Hongrie
- Rubenstein School of Environment and Natural Resources, Université du Vermont, Burlington, USA
Personnes impliquées
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AMILIEN Flavie, Adjointe technique principale
Téléphone : +33 2 23 48 56 69 Email : flavie.amilien@inrae.fr |
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COLLINET Marc, Technicien de recherche
Téléphone : +33 2 23 48 55 29 Email : marc.collinet@inrae.fr |
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COUDREUSE Julie, Ingénieur(e) d'étude
Téléphone : +33 2 23 48 55 43 Email : julie.coudreuse@institut-agro.fr |
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DÉZERALD Olivier, Chargé(e) de Recherche
Téléphone : +33 2 23 48 54 46 Email : olivier.dezerald@inrae.fr |
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EDELINE Eric, Directeur(rice) de recherche
Téléphone : +33 2 23 48 55 23 Email : eric.edeline@inrae.fr |
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FENG Mingjun, Doctorant(e)
Téléphone : +33 7 82 58 35 99 Email : mingjun.feng@inrae.fr |
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FOURCY Damien, Ingénieur(e) d'étude
Téléphone : +33 2 23 48 70 09 Email : damien.fourcy@inrae.fr |
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GAIGNÉ Emilien, Doctorant(e)
Email : emilien.gaigne@inrae.fr |
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GORZERINO Caroline, Ingénieur(e) d'étude
Téléphone : +33 2 23 48 70 37 Email : caroline.gorzerino@inrae.fr |
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KETAVONG Setha, Technicien de recherche
Email : setha.ketavong@inrae.fr |
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PETIT Eric, Directeur(rice) de recherche
Téléphone : + 33 2 23 48 70 36 Email : eric.petit@inrae.fr |
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PORCON Béatrice, Technicienne
Téléphone : +33 2 23 48 56 69 Email : beatrice.porcon@inrae.fr |
Financements
DECOD