LAUNEY Sophie
 |
Scientist Theme(s) : Population dynamics, life history trait, Ecology
Address: UMR DECOD, 65 rue de Saint-Brieuc Bât. 15 , CS 84215, 35042 Rennes Cedex, France Keywords: Evolutionary biology, Population genetics, Migration, Anadromy, Diadromous fish, Adaptation  |
Expertise
Population genetics, Evolutionary biology, Adaptation
Research
Current Research Topics
My current projects aim to study the determinism, evolution and adaptive consequences of the variability of migratory behaviour in brown trout Salmo trutta, in correlation with the adaptation of populations to their environment (habitat, trophic resources, presence of sympatric species). The goal is to identify gene flow between populations (at various spatial and temporal scales) and the role of the migratory form (sea trout) in structuring the genetic variability between and within populations. This will help provide recommendations for the genetic conservation of the species in French rivers. This question is part of a larger scientific issue: the relation between human activities and evolution of amphihaline fish communities in France and Europe, particularly in a global change context, which could result in changes in life-history strategies, such as alternative migratory tactics in several species.
Collaborations
- ECOBIOP research unit, INRAE St Pée sur Nivelle
- UMR LPGP, INRAE Rennes
- U3E, INRAE Rennes
- University of Exeter, UK
Current projects
SELUNE Multidisciplinary study of the Selune river restoration following the removal of two large dams | Timeframe : 2012 - 2028 Keywords : Connectivité / Cycle de vie / Dynamique des populations / Ecologie spatiale / Fronts de colonisation / Habitats essentiels / Interactions trophiques / Invasions biologiques / Migration / Restauration / Barrages / Biofilms / Communautés / Dispersion / Ecosystèmes / Individus / Macroinvertébrés / Phytoplankton / Plantes / Poissons / Populations / ADNe / Analyses de séries temporelles / Biologging / Capture, échantillonnage et inventaire / Génétique quantitative / Hydroacoustique / Isotopes stables / Marquage-recapture / Télémétrie |
Salmonid Management Round the Channel | Timeframe : 2017 - 2023 Keywords : Cycle de vie / Dynamique des populations / Ecologie spatiale / Evaluation / Migration / Plasticité phénotypique / Traits d’histoire de vie / Traits phénotypiques / Age à maturité / Changement climatique / Dispersion / Fécondité / Individus / Poissons / Populations / Survie / Taille à maturité / Taux de croissance corporelle / Analyse de pièces calcifiées / Analyses de séries temporelles / Biomarqueurs et traceurs / Capteurs / Capture, échantillonnage et inventaire / Génétique quantitative / Hydroacoustique / Isotopes stables / Marquage-recapture / Modélisation mécaniste / Modélisation statistique / Statistiques multivariées |
M.Sc. and Ph.D. Supervision
M.Sc. Students
RAFFAULT, C. (2021) .Evaluer l?impact environnemental et des activites anthropiques sur la connectivite de la truite commune (Salmo trutta) dans la Manche a l?aide de graphs de populations et de modeles de gravite
NOTTELLET, S. (2017) .Influence du paysage et des tactiques migratoires sur la diversite immunogenetique des populations cotieres de truites communes (Salmo trutta L.) de la Manche>>
PORTANIER, E. (2015) .Population organisation of cave-living bats communities. A population genetics approach
HIVERT, V. (2015) .Using Rad-seq data for the estimation of dispersal parameters
DOLO, V. (2014) .Impact des obstacles a la migration sur la structuration genetique des populations de lamproies de Planer (Lampetra planeri) et de lamproies fluviatiles (L. fluviatilis)
ROUGEMONT, Q. (2012) .Etude de la differenciation et de la dispersion des populations des deux especes d?Aloses (Alosa spp) en France : apport de la genetique des populations et de la microchimie des otolithes. Memoire de Fin d'Etudes, Diplome d?Ingenieur de l?Institut Superie
GAIGHER, A. (2011) .Mesure du flux de genes entre populations de lamproie fluviatile et de lamproie de Planer. Memoire de 2eme annee Master Sciences De l'Univers, Environnement, Ecologie (SDUEE), Specialite Ecologie, Biodiversite, Evolution (EBE), UPMC-UPS-AgroParisTech- ENS
Ph.D. Students
DELORD, C. (2019) .Gestion des ressources halieutiques du Haut-Maroni : Impact de la pression de peche et des traits d?histoire de vie des especes sur la diversite genetique intra- et interpopulations
ROUGEMONT, Q. (2015) .Evolution de la divergence entre la lamproie fluviatile (Lampetra fluviatilis) et la lamproie de planer (L. planeri) inferee par des approches experimentales et de genomique des populations
Publications
Selection of Scientific Products
Besnard Anne-Laure, Meslier Lisa, Jousseaume Thibaut, Nevoux Marie, Marchand Frederic, Launey Sophie (2023). Fast, safe and high-throughput Real-Time PCR protocol for molecular sex identification in Salmo salar, applicable to historic scale collections. 2023
Vanhove Mathieu, Launey Sophie (2023). Estimating resistance surfaces using gradient forest and allelic frequencies. Molecular Ecology Resources, 2023, ⟨10.1111/1755-0998.13778⟩
Delord Chrystelle, Petit Eric J., Blanchet Simon, Longin Guillaume, Rinaldo Raphaelle, Vigouroux Régis, Roussel Jean-Marc, Le Bail Pierre-Yves, Launey Sophie (2023). Contrasts in riverscape patterns of intraspecific genetic variation in a diverse Neotropical fish community of high conservation value. Heredity, In press, ⟨10.1038/s41437-023-00616-7⟩
Osmond Daniel, King R. Andrew, Stockley Bruce, Launey Sophie, Stevens Jamie (2023). A low‐density single nucleotide polymorphism panel for brown trout ( Salmo trutta L.) suitable for exploring genetic diversity at a range of spatial scales. Journal of Fish Biology, 2023, 102 (1), pp.258-270. ⟨10.1111/jfb.15258⟩
Rougemont Quentin, Perrier Charles, Besnard Anne-Laure, Lebel Isabelle, Abdallah Yann, Feunteun Eric, Réveillac Elodie, Lasne Emilien, Acou Anthony, Nachón David José, Cobo Fernando, Evanno Guillaume, Baglinière Jean-Luc, Launey Sophie (2022). Population genetics reveals divergent lineages and ongoing hybridization in a declining migratory fish species complex. Heredity, Nature Publishing Group, 2022, 129 (2), pp.137-151. ⟨10.1038/s41437-022-00547-9⟩
Druet Morgan, Rault Pablo, Acou Antony, Azam Didier, Bardonnet Agnes, Lasne Emilien, Evanno Guillaume, Feunteun Eric, Launey Sophie, Lizé Anne, Martignac François, Nevoux Marie, Prod’homme Jordane, Emma Robin, Teichert Nils, Petit Eric, Marchand Frédéric (2021). Dispersion et (re)colonisation du cours de la Sélune et de ses affluents : terminer un état de référence pour les poissons migrateurs amphihalins et anticiper l’expansion spatiale de l’écrevisse de Californie. [Rapport de recherche] Convention n°1078068, Agence de l'Eau Seine-Normandie. 2021, pp.30
Rougemont Quentin, Dolo Victoria, Oger Adrien, Besnard Anne-Laure, Huteau Dominique, Coutellec Marie-Agnès, Perrier Charles, Launey Sophie, Evanno Guillaume (2021). Riverscape genetics in brook lamprey: genetic diversity is less influenced by river fragmentation than by gene flow with the anadromous ecotype. Heredity, Nature Publishing Group, 2021, 126 (2), pp.235-250. ⟨10.1038/s41437-020-00367-9⟩
Jousseaume Thibaut, Roussel Jean-Marc, Beaulaton Laurent, Bardonnet Agnes, Faliex Elisabeth, Amilhat Elsa, Acou Anthony, Feunteun Eric, Launey Sophie (2021). Molecular detection of the swim bladder parasite Anguillicola crassus (Nematoda) in fecal samples of the endangered European eel Anguilla anguilla. Parasitology Research, Springer Verlag (Germany), 2021, ⟨10.1007/s00436-021-07100-3⟩
Mendoza Carlos, Désert Anthony, Chateau Denis, Monnereau Cyrille, Khrouz Lhoussain, Lerouge Fréderic, Andraud Chantal, Monbaliu Jean-Christophe, Parola Stephane, Heinrichs Benoît (2020). Au nanobipyramids@mSiO2 core–shell nanoparticles for plasmon-enhanced singlet oxygen photooxygenations in segmented flow microreactors. Nanoscale Advances, RSC, 2020, 2 (11), pp.5280 - 5287. ⟨10.1039/d0na00533a⟩
Lepais Olivier, Chancerel Emilie, Boury Christophe, Salin Franck, Manicki Aurélie, Taillebois Laura, Dutech Cyril, Aissi Abdeldjalil, Bacles Cécile, Daverat Françoise, Launey Sophie, Guichoux Erwan (2020). Fast sequence-based microsatellite genotyping development workflow. PeerJ, PeerJ, 2020, 8, pp.1-28. ⟨10.7717/peerj.9085⟩