Boulenger Clarisse, Roussel Jean-Marc, Beaulaton Laurent, Martignac François, Nevoux Marie (2024). Diadromous fish run assessment: a double-observer model using acoustic cameras to correct imperfect detection and improve population abundance estimates. Frontiers in Ecology and Evolution, 2024, 11, ⟨10.3389/fevo.2023.1250785⟩

  Fernandez Garcia Guglielmo, Corpetti Thomas, Nevoux Marie, Beaulaton Laurent, Martignac François (2023). AcousticIA, a deep neural network for multi-species fish detection using multiple models of acoustic cameras. Aquatic Ecology, 2023, 57 (4), pp.881-893. ⟨10.1007/s10452-023-10004-2⟩

  Rogissart Hervé, Rautureau Clément, Cattanéo Franck, Goulon Chloé, Martignac François, Guillard Jean (2023). Acoustic camera, a non-invasive approach to monitor whitefish spawning phenology in the shallow water areas of peri-alpinelakes. 15th International Symposium on Biology and Management of Coregonid fishes (ISBMC), Sep 2023, Evian les Bains, France

  Jaballah Sami, Fernandez Garcia Guglielmo, Martignac François, Parisey Nicolas, Jumel Stéphane, Roussel Jean-Marc, Dézerald Olivier (2023). A deep learning approach to detect and identify live freshwater macroinvertebrates. Aquatic Ecology, 2023, 57 (4), pp.933-949. ⟨10.1007/s10452-023-10053-7⟩

  Le Quinio Azénor, de Oliveira Eric, Girard Alexandre, Guillard Jean, Roussel Jean-Marc, Zaoui Fabrice, Martignac François (2023). Automatic detection, identification and counting of anguilliform fish using in situ acoustic camera data: Development of a cross-camera morphological analysis approach. PLoS ONE, 2023, 18 (2), pp.e0273588. ⟨10.1371/journal.pone.0273588⟩

  Fernandez Garcia Guglielmo, Corpetti Thomas, Nevoux Marie, Beaulaton Laurent, Martignac François (2023). AcousticIA, a deep neural network for multi-species fish detection using multiple models of acoustic cameras. Aquatic Ecology, 2023, ⟨10.1007/s10452-023-10004-2⟩

  Bellon-Maurel Véronique, Lutton Evelyne, Bisquert Pierre, Brossard Ludovic, Chambaron Stephanie, Labarthe Pierre, Lagacherie Philippe, Martignac François, Molenat Jérôme, Parisey Nicolas, Picault Sébastien, Piot-Lepetit Isabelle, Veissier Isabelle (2022). Digital revolution for the agroecological transition of food systems: a responsible research and innovation perspective. Agricultural Systems, 2022, 203, pp.103524. ⟨10.1016/j.agsy.2022.103524⟩

  Le Quinio Azénor, de Oliveira Eric, Girard Alexandre, Guillard Jean, Roussel Jean-Marc, Zaoui Fabrice, Martignac François (2022). Automatic detection, identification and counting of anguilliform fish using in situ acoustic camera data: development of a cross-camera morphological analysis approach. BioRxiv, In press, ⟨10.1101/2022.08.11.503684⟩

  Martignac François, Baglinière Jean-Luc, Ombredane Dominique, Guillard Jean (2021). Efficiency of automatic analyses of fish passages detected by an acoustic camera using Sonar5-Pro. Aquatic Living Resources, 2021, 34 (2), 10 p. ⟨10.1051/alr/2021020⟩

  Martignac François, Beaulaton Laurent (2021). Acquisition d’une caméra acoustique BluePrint Oculus M750d. OFB; Inrae. 2021, 20 p

  Martignac François, Beaulaton Laurent (2021). Tests de performance de la caméra acoustique BluePrint Oculus M750d. Fiche synthèse, Inrae; OFB. 2021, 2 p

  Fernandez Garcia Guglielmo, Martignac François, Nevoux Marie, Beaulaton Laurent, Corpetti Thomas (2021). A deep neural network for multi-species fish detection using multiple acoustic cameras. 2021

  Druet Morgan, Rault Pablo, Acou Antony, Azam Didier, Bardonnet Agnes, Lasne Emilien, Evanno Guillaume, Feunteun Eric, Launey Sophie, Lizé Anne, Martignac François, Nevoux Marie, Prod’homme Jordane, Emma Robin, Teichert Nils, Petit Eric, Marchand Frédéric (2021). Dispersion et (re)colonisation du cours de la Sélune et de ses affluents : terminer un état de référence pour les poissons migrateurs amphihalins et anticiper l’expansion spatiale de l’écrevisse de Californie. [Rapport de recherche] Convention n°1078068, Agence de l'Eau Seine-Normandie. 2021, pp.30

  Lasne Emilien, Chaubet Théo, Martignac François, Tremblay Julien (2020). Déplacements et utilisation des habitats par les poissons migrateurs sur la Sélune. [Rapport de recherche] OFB; INRAE; Institut Agro - Agrocampus Ouest; UPPA. 2020, 26 p

  Fernandez Garcia Guglielmo, Martignac François, Corpetti Thomas, Nevoux Marie, Beaulaton Laurent (2020). Automatisation De L'analyse De Données Des Caméras Acoustiques Par Réseaux De Neurones Convolutifs (CNN) Rapport d'étape. [Rapport de recherche] OFB; INRAE; Institut Agro - Agrocampus Ouest; UPPA. 2020, 13 p

  Daroux Aurélie, Martignac François, Nevoux Marie, Baglinière Jean-Luc, Ombredane Dominique, Guillard Jean (2019). Manual fish length measurement accuracy for adult river fish using an acoustic camera (DIDSON). Journal of Fish Biology, Wiley, 2019, 95 (2), pp.480-489. ⟨10.1111/jfb.13996⟩

  Boulenger Clarisse, Martignac François, Nevoux Marie, Roussel Jean-Marc, Beaulaton Laurent (2018). Estimation des flux de poissons sur le cas d'étude 2. [Rapport de recherche] OFB. 2018

  Boulenger Clarisse, Martignac François, Nevoux Marie, Beaulaton Laurent (2018). Mode d’emploi pour l’utilisation des modèles du projet Toolbox. [Rapport Technique] OFB. 2018

  Martignac François, Provost Pascal, Nevoux Marie (2018). Mapping the kelp distribution area of the Sept-Iles marine reserve (Brittany, France) using hydroacoustics. SFE² International Conference on Ecological Sciences, Oct 2018, Rennes, France

  Boulenger Clarisse, Martignac François, Nevoux Marie, Roussel Jean-Marc, Beaulaton Laurent (2018). Recommandations pour la mise en œuvre de la boite à outils pour estimer les flux de migrations des espèces diadromes.. [Rapport Technique] OFB. 2018

  Boulenger Clarisse, Martignac François, Beaulaton Laurent, Roussel Jean-Marc, Nevoux Marie (2018). Combining an innovative monitoring method and a hierarchical bayesian model to estimate diadromous fish run. SFE² International Conference on Ecological Sciences, 2018, Rennes, France

  Petit Eric, Acou Anthony, Azam Didier, Bardonnet Agnes, Barloy Dominique, Benneveault yoann, Besnard Anne-Laure, Bolliet Valérie, Boulenger Clarisse, Coste-Heinrich Pascale, Coudreuse Julie, Daroux Aurélie, Evanno Guillaume, Feunteun Eric, Forget Guillaume, Guillard Jean, Huchet Emmanuel, Huteau Dominique, Lassalle Gilles, Launey Sophie, Le Quilliec Patricia, Macel Nicolas, Manicki Aurélie, Marchand Frédéric, Martignac François, Nevoux Marie, Oger Adrien, Ombredane Dominique, Paillisson J.M., Poupelin Maxime, Réveillac Elodie, Rault Pablo, Rives Jacques, Fraisse Stéphane, Baglinière Jean-Luc (2017). Dispersion et (re)colonisation du cours de la Sélune et de ses affluents. [Rapport de recherche] Convention n°1054505-1, Agence de l'Eau Seine-Normandie. 2017, pp.46

  Boulenger Clarisse, Martignac François, Nevoux Marie, Chapon Pierre-Marie, Roussel Jean-Marc, Beaulaton Laurent (2017). Avantages et limites des dispositifs d’observations. [Rapport Technique] OFB. 2017

  Boulenger Clarisse, Martignac François, Beaulaton Laurent, Roussel Jean-Marc, Nevoux Marie (2017). Combining an innovative monitoring method and a hierarchical Bayesian model to estimate siadromous fish run. 50th FSBI Synmposium, 2017, Exceter, United Kingdom

  Martignac François (2016). Analysis of the Atlantic salmon migration dynamic (Salmo salar L.) on two rivers of the Mont-Saint-Michel Bay using hydroacoustic devices. Biodiversité et Ecologie. Agrocampus Ouest, 2016. Français. ⟨NNT : 2016NSARH097⟩

  Daroux Aurélie, Boulenger Clarisse, Nevoux Marie, Martignac François, Guillard Jean, Ombredane Dominique, Baglinière Jean-Luc (2016). Dispersion et (re)colonisation, suivi Didson. [Rapport de recherche] Agence de l'Eau Seine-Normandie. 2016, pp.18

  Petit Eric, Acou Anthony, Azam Didier, Bardonnet Agnes, Barloy Dominique, Benneveault yoann, Besnard Anne-Laure, Bolliet Valérie, Boulenger Clarisse, Coste-Heinrich Pascale, Coudreuse Julie, Daroux Aurélie, Evanno Guillaume, Feunteun Eric, Forget Guillaume, Guillard Jean, Huchet Emmanuel, Prévost Etienne, Lepais Olivier, Huteau Dominique, Launey Sophie, Le Quilliec Patricia, Marchand Frédéric, Martignac François, Nevoux Marie, Oger Adrien, Ombredane Dominique, Paillisson J.M., Poupelin Maxime, Réveillac Elodie, Rault Pablo, Rives Jacques, Baglinière Jean-Luc (2016). Dispersion et (re)colonisation du cours de la Sélune et de ses affluents. [Rapport de recherche] Agence de l'Eau Seine-Normandie. 2016, pp.18

  Boulenger Clarisse, Martignac François, Nevoux Marie, Roussel Jean-Marc, Beaulaton Laurent (2016). Rapport d’étude : Estimation des flux de salmonidés sur la Sélune (cas d’étude 1). [Rapport de recherche] OFB; INRA. 2016

  Le Gonidec Claude, Grimaldi C., Crave Alain, Rollet Anne-Julia, Beauchamp Axel, Lespez Laurent, Martignac François, Saxer S., Daroux Aurélie, Forget Guillaume, Côte J., Baglinière Jean-Luc, Ombredane Dominique, Guillard Jean (2015). A : Dynamique fluviale : Flux hydriques, sédimentaires et chimiques et Géormorphologie -B : Biocénoses aquatiques : Suivi des flux migratoires de poissons par Hydroacoustique (DIDSON) et Caractérisation biologique et toxicologique de la population de poissons dans la retenue de Vezins[Rapport d'étape annuel 2014 - Programme Sélune Phase pré-arasement]. [Rapport de recherche] Agence de l'Eau Seine-Normandie. 2015, pp.96

  Martignac François, Hemon Audrey, Blancher Philippe (2015). Hydroacoustique et poissons migrateurs amphihalins : analyse innovante de leur dynamique migratoire. Sciences Eaux & Territoires, 2015, 17, pp.1-6. ⟨10.14758/SET-REVUE.2015.17.04⟩

  Martignac François, Daroux Aurélie, Baglinière Jean-Luc, Ombredane Dominique, Guillard Jean (2014). The use of acoustic cameras in shallow waters: new hydroacoustic tools for monitoring migratory fish population. A review of DIDSON technology. Fish and Fisheries, 2014, 16 (3), pp.na/na. ⟨10.1111/faf.12071⟩

  Daroux Aurélie, Martignac François, Guillard Jean (2014). Utilisation de la caméra acoustique DIDSON pour le suivi en rivière des poissons migrateurs. Cahier des Techniques de l'INRA, 2014, 83 (3), pp.1-8

  Martignac François, Le Gonidec Claude, Daroux Aurélie, Guillard Jean, Baglinière Jean-Luc, Grimaldi C., Crave Alain (2014). A : Biocénose : suivi des flux migratoires de poissons par hydroacoustique (DIDSON)B : Géomorphologie, flux (sédimentaires, hydriques et chimiques) et relation avec les habitats[Rapport d'étape annuel 2014 - Programme Sélune Phase pré-arasement]. [Rapport de recherche] Agence de l'Eau Seine-Normandie. 2014, pp.50

  Daroux Aurélie, Martignac François, Guillard Jean (2014). Utilisation de la caméra acoustique DIDSON pour le suivi en rivière des poissons migrateurs. Le Cahier des Techniques INRAE, 2014

  Forget Guillaume, Martignac François, Marchand Frédéric, Daroux Aurélie, Guillard Jean, Ombredane Dominique, Nevoux Marie, Richard Arnaud, Baglinière Jean-Luc (2014). Mise au point des méthodes de caractérisation de l'état du peuplement de poissons et espèces assimilées sur la Sélune [Rapport d’étape 3ème année - Décembre 2014]. [Rapport de recherche] ONEMA; INRA. 2014, pp.64

  Forget Guillaume, Martignac François, Marchand Frédéric, Daroux Aurélie, Thieulle Laurent, Guillard Jean, Paillisson J.M., Acou Anthony, Feunteun Eric, Baglinière Jean-Luc (2013). Mise au point des méthodes de caractérisation de l'état du peuplement de poissons et espèces assimilées sur la Sélune [Rapport d’étape 2ème année - Décembre 2013]. [Rapport de recherche] ONEMA (Office National de l'Eau et des Milieux Aquatiques); INRA. 2013, pp.58

  Martignac François, Baglinière Jean-Luc, Thieulle L., Ombredane Dominique, Guillard Jean (2013). Influences of a dam on Atlantic salmon (Salmo salar) upstream migration in the Couesnon River (Mont Saint Michel Bay) using hydroacoustics. Estuarine, Coastal and Shelf Science, 2013, 134, pp.181-187. ⟨10.1016/j.ecss.2013.02.003⟩

  van Baaren Joan, Baglinière Jean-Luc, Martignac François, Bal Guillaume, Le Lann Cécile, Roussel Jean-Marc (2013). Perturbations des habitats et chaînes trophiques dans les écosystèmes continentaux aquatiques et terrestres. Merot P., Dubreuil V., Delahaye D. & Desnos P. Changement climatique dans l'Ouest. Evaluation, impacts, perceptions., Presses Universitaires de Rennes, pp.265-289, 2013, Espace et Territoires, 978-2-7535-2146-9

  Forget Guillaume, Martignac François, Marchand Frédéric, Daroux Aurélie, Thieulle Laurent, Guillard Jean, Baglinière Jean-Luc (2012). Mise au point des méthodes de caractérisation de l'état du peuplement de poissons et espèces assimilées sur la Sélune [Rapport d’étape décembre 2012]. [Rapport de recherche] ONEMA (Office National de l'Eau et des Milieux Aquatiques); INRA. 2012