Staff

COUTELLEC Marie-Agnès

Scientist
Theme(s) :
Population dynamics, life history trait, Ecology
Stakeholders information support for sustainable management of ecosystems
Phone: +33 2 23 48 52 48 Email : marie-agnes.coutellec@inrae.fr
Address: UMR DECOD, 65 rue de Saint-Brieuc, Bât. 15, CS 84215, 35042 Rennes Cedex, France
Keywords: Evolutionary ecotoxicology, Population genetics, Genomics, Hermaphrodite mating system

Expertise

Evolutionary Biology and Ecotoxicology

Current Position

Research scientist
Special assistant in charge of Ecotoxicology, AQUA Scientific Division

Research

Current Research Topics

The main topic of my research is evolutionary ecotoxicology. I am interested in understanding how natural populations cope with anthropogenic disturbances in the long run, especially those triggered by pesticides on non-target aquatic organisms.

My work primarily focuses on the genetic components of variation in population responses to toxicants, including quantitative traits (life history) and gene expression (transcriptomics, molecular pathways). Oxidative stress is given particular attention in this context, due to its putative role in life-history trade-offs.
As an applied environmental perspective of this work, results are used to raise arguments and to propose potential tools to incorporate an evolutionary component into future procedures of ecological risk assessment (ERA).

Using a hermaphroditic animal species, the great pond snail, and building on the relative importance of genetic and ecological determinants of self-fertilisation, we also investigate the role of mating system on stress response and population adaptive processes, and test fundamental hypotheses on the evolution of self-fertilisation. Additionally, using transcriptomics, I contribute to studying the effects of endocrine disruptors on the great pond snail, used in this context as invertebrate model for reprotoxicity testing.

Collaborations
  • CEFE, CNRS: P. David, P. Jarne
  • Genotoul Toulouse: O. Bouchez, N. Marsaud, C. Klopp, C. Noirot
  • INRAE UMR CARRTEL: A. Bouchez, F. Rimet
  • L. stagnalis genome sequencing international consortium. (Main partners: C Klopp, Génotoul Toulouse ; A Davison, Nottingham ; ZP Feng, Toronto; J Koene, Amsterdam; D Jackson, Göttingen).
  • Genoscope : A. Madoui, V. Barbe, B. Noël
  • CEA : J. Armengaud, C. Almunia
  • Jinhee Choi, Seoul University
  • Yumi Nakadera, Bielefeld University
  • University of Gent, Belgium : K. De Schamphelaere
  • CSIC, Barcelona, Spain: C. Barata

 

Current projects

Genomic resources in Lymnaea stagnalis

EGELYS

Timeframe : 2010 -
Keywords : Genetic markers, Microsatellites, SNPs, transcriptomics, RNAseq, Lymnaea stagnalis.

Past projects

Evolving to xenobiotic induced stress

EVOTOXIS

Timeframe : 2018 - 2021
Keywords : Daphnies, Ecotoxicologie, Stress oxydatif, Génomique fonctionnelle

Eco-evolutionary dynamics in response to anthropogenic perturbations

NOUVEAU

Timeframe : 2018 - 2021
Keywords : Evolution rapide, Expérimentations, Invasions biologiques, Pêcheries, Phénotypes, Réseaux trophiques

Transgenerational Effects of MIT in Aquatic Ecosystems

TrEMIT

Timeframe : 2018 - 2020
Keywords : Daphnies, Ecotoxicologie, Génomique fonctionnelle, Epigénétique, Méthylisothiazolinone

Molecular analysis of the response to selection in a hermaphrodite organism exposed to diquat

PROTEOLYST

Timeframe : 2017 - 2018
Keywords : Ecotoxicologie, Protéogénomique, Consanguinité, Exposition multigénération, Pesticides, <i>Lymnaea stagnalis</i>

Evolution of Self-fertilisation in Hermaphrodites, an Animal Perspective

ESHAP

Timeframe : 2013 - 2016
Keywords : évolution des systèmes de reproduction, dépression de consanguinité, réponse à la sélection, stress environnemental

Properties and ligand affinity of endocrine disruptor-binding receptors in <i>Lymnaea stagnalis</i> (Mollusc, Gastropod)

PLAYLYST

Timeframe : 2014 - 2016
Keywords : récepteur aux oestrogènes, récepteur X aux rétinoïdes, test <i>in vitro</i>, transfection cellulaire, prédiction <i>in silico</i>, modélisation du domaine de fixation des ligands

Implementation of <i>Macrobrachium</i> spp. as a sentinel species for monitoring the quality of surface water in Guadeloupe and Martinique (French West Indies)

MACROSENS

Timeframe : 2013 - 2015
Keywords : biomonitoring, crevette, écotoxicologie tropicale, rivières, contaminants organiques, pesticides, biomarqueurs, neurotoxicité, génotoxicité, enzymes de biotransformation, perturbation endocrinienne, dynamique de populations, génétique de populations, phylogéographie

Polluo-sensitivity and Phylogeny

PHYLOTOX

Timeframe : 2012 - 2015
Keywords : bioindication, signal phylogénétique, norme de réaction aux polluants, écosystèmes aquatiques

Predictive potential of molecular markers of endocrine disruption in aquatic invertebrates: relationships between transcriptome, proteome and reprotoxicity

CREOLE

Timeframe : 2011 - 2014
Keywords : évaluation du risque environnemental, pesticides, perturbateurs endocriniens, mollusques, crustacés, criblage, transcriptomique, protéomique, reprotoxicité, critère d'exclusion

Consulting Experience

 

 

Teaching Experience

 

  • 1999-2004 and 2006-2007: Lecturer position, Rennes 1 University (Animal Biology, Evolutionary Biology, Biostatistics).
  • 2007- 2017: Ecotoxicology (Master “Environmental Engineering” Agrocampus Ouest Rennes), Master “Ecology Toxicology University of Angers, France), Hermaphroditic mating systems Master EFCE (University of Rennes 1), Biostatistics (Licence “Organismal Biology”, University of Rennes 1)

M.Sc. and Ph.D. Supervision

Master

Samuel Hermant (M1 IMABEE, Rennes1 University, 2020). Effet du mode de reproduction sur la réponse à la sélection pour l’autofécondation: test expérimental chez Lymnaea stagnalis ; Cosupervision (50%) with E. Edeline.

Nolwenn Decanter (M2 Biodiversité, Ecologie et Evolution, Rennes1 University, 2018-2019). Mechanisms of sex determination in fishes. Cosupervision (20%) with G. Evanno, A. Souissi and S. McCairns.

Fabien Cichonski (M1 Ecologie Fonctionnelle, Comportementale et Evolutive, Université Rennes1, 2017). Evaluation de méthodes d’étude des communautés microalgales d’eau douce : microscopie optique, spectrophotométrie et fluorimétrie. Cosupervision (50%) with C. Gorzerino.

Marlène Bonnaud (M2 Ecologie Comportementale, Evolution, Biodiversité, University of Tours, 2015-2016). Lien entre phylogénie et polluosensibilité chez les insectes aquatiques. Cosupervision (50%) with F. Keck and A. Bouchez (UMR CARRTEL, Thonon-Les-Bains).

Adélaïde Duval (M1 EFCE Ecologie Fonctionnelle, Comportementale et Evolutive, Rennes1 University, 2015). Réponse à la sélection chez un organisme hermaphrodite : rôle de l’autofécondation chez Lymnaea stagnalis.

Victoria Dollo (M2 Biologie Moléculaire et Cellulaire, UPMC, 2013-2014). Impact des obstacles à la migration sur la structuration génétique de populations de lamproies de Planer et de lamproies fluviatiles. Cosupervision  (25%) with G. Evanno, S. Launey and Q. Rougemont.

Valérie Lopez (M2 Ecologie Fonctionnelle, Comportementale et Evolutive, Rennes1 University, 2012-2013). Performances des hybrides truite-saumon face aux stress climatiques. Cosupervision (25%) with G. Evanno, JM Roussel, and J. Côte.

Damien Choisne (M1 Bioinformatics,  Rennes1 University, 2011). Contribution à l’analyse de données de séquençage de transcriptome chez un mollusque gastéropode d’eau douce, Lymnaea stagnalis, exposé à un herbicide.

 

PhD

Margot Wagner : Effets transgénérationnels du biocide CMIT/MIT sur une espèce clé de voûte des écosystèmes d’eau douce.  2019-2022. Cosupervision (50%) with Scott McCairns.

Anthony Bouétard : « Potentiel évolutif des réponses transcriptomiques et phénotypiques vis-à-vis du stress d’origine anthropique : le case de Lymnaea stagnalis exposée aux pesticides ». 2009-2013. Contrat Jeune Scientifique (CJS-INRA).

Post-docs

Paul Boisseaux : Analyse moléculaire de la réponse à la sélection par le diquat chez un organisme hermaphrodite, approche protéo-génomique. 2018.

Audrey Chaput-Bardy : Dispersion et dynamique des populations chez  Macrobrachium spp. aux Antilles (MACROSENS-CMR). 2013-2015.

Collective responsibility

AQUA Division: executive team member, in charge of Ecotoxicology.

M.Sc. Students

HERMANT, S. (2020) .Selection densite-dependante sur les taux d?autofecondation : test experimental chez la limnee des etangs

DECANTER, N. (2019) .Identification de genes lies a la differenciation sexuelle chez les lamproies

BONNAUD, M. (2016) .Phylogenie et polluosensibilite d'insectes aquatiques

DUVAL, A. (2015) .Reponse a la selection chez un organisme hermaphrodite : role de l'autofecondation

DOLO, V. (2014) .Impact des obstacles a la migration sur la structuration genetique des populations de lamproies de Planer (Lampetra planeri) et de lamproies fluviatiles (L. fluviatilis)

LOPEZ, V. (2013) .Influence de l'environnement sur les performances des hybrides de saumon Atlantique et de truite commune

CHOISNE, D. (2011) .Contribution a l?analyse de donnees de sequencage de transcriptome chez un mollusque gasteropode d?eau douce, Lymnaea stagnalis, expose a un herbicide. Master 1, Modelisation de systemes biologiques, Universite Rennes 1. Collaboration Genotoul, plateforme

Ph.D. Students

WAGNER, M. (2023). Toxicité de la méthylisothiazolinone sur l’espèce clé de voûte des écosystèmes d’eau douce Daphnia pulex

BOUETARD, A. (2013) .Potentiel evolutif des reponses transcriptomiques et phenotypiques vis-a-vis du stress d?origine anthropique : le cas de Lymnaea stagnalis exposee aux pesticides

Publications

Selection of Scientific Products

Mamy Laure, Pesce Stéphane, Sanchez Wilfried, Aviron Stéphanie, Bedos Carole, Berny Philippe, Bertrand Colette, Betoulle Stephane, Charles Sandrine, Chaumot Arnaud, Coeurdassier Michael, Coutellec Marie-Agnès, Crouzet Olivier, Fabure Juliette, Fritsch Clémentine, Gonzalez Patrice, Hedde Mickael, Leboulanger C, Margoum Christelle, Mougin Christian, Munaron Dominique, Nelieu Sylvie, Pelosi Céline, Rault Magali, Sucre Elliott, Thomas Marielle, Tournebize Julien, Leenhardt Sophie (2024). Impacts des néonicotinoïdes sur la biodiversité. 52ème congrès du Groupe Français de recherche sur les Pesticides, INRAE; Groupe Français de recherche sur les Pesticides, May 2024, Lyon, France

Mamy Laure, Pesce Stéphane, Sanchez Wilfried, Aviron Stéphanie, Bedos Carole, Berny Philippe, Bertrand Colette, Betoulle Stephane, Charles Sandrine, Chaumot Arnaud, Coeurdassier Michael, Coutellec Marie-Agnès, Crouzet Olivier, Fabure Juliette, Fritsch Clémentine, Gonzalez Patrice, Hedde Mickael, Leboulanger C, Margoum Christelle, Mougin Christian, Munaron Dominique, Nelieu Sylvie, Pelosi Céline, Rault Magali, Sucre Elliott, Thomas Marielle, Tournebize Julien, Leenhardt Sophie (2024). Impacts des néonicotinoïdes sur la biodiversité. Séminaire EcoScience, INRAE UMR EcoSys, Apr 2024, Palaiseau, France

Pesce Stéphane, Mamy Laure, Sanchez Wilfried, Artigas Joan, Bérard Annette, Betoulle Stéphane, Chaumot Arnaud, Coutellec Marie-Agnès, Crouzet Olivier, Faburé Juliette, Hedde Mickael, Leboulanger Christophe, Margoum Christelle, Martin-Laurent Fabrice, Morin Soizic, Mougin Christian, Munaron Dominique, Nélieu Sylvie, Pelosi Céline, Leenhardt Sophie (2024). The use of copper as plant protection product contributes to environmental contamination and resulting impacts on terrestrial and aquatic biodiversity and ecosystem functions. Environmental Science and Pollution Research, In press, ⟨10.1007/s11356-024-32145-z⟩

Koene Joris, Jackson Daniel J., Nakadera Yumi, Cerveau Nicolas, Madoui Mohammed‐amin, Noel Benjamin, Jamilloux Véronique, Poulain Julie, Labadie Karine, Silva Corinne, Davison Angus, Feng Zhong-Ping, Adema Coen, Klopp Christophe, Aury Jean-Marc, Wincker Patrick, Coutellec Marie-Agnès (2024). The genome of the simultaneously hermaphroditic snail Lymnaea stagnalis reveals an evolutionary expansion of FMRFamide-like receptors. 2024

Coutellec Marie-Agnès, Chaumot Arnaud, Sucré Elliott (2024). Neglected impacts of plant protection products on invertebrate aquatic biodiversity: a focus on eco-evolutionary processes. Environmental Science and Pollution Research, In press, ⟨10.1007/s11356-024-32767-3⟩

Coutellec Marie-Agnès, Denaix Laurence, Fabure Juliette, Lamy Isabelle, Martin-Laurent Fabrice, Morin Soizic, Mougin Christian (2023). VIIIème Colloque du Réseau Ecotox (Ecotoxicologues terrestres et aquatiques). Changement climatique et écotoxicologie ou l'écotoxicologie + 2°C, 2023

Pesce Stéphane, Mamy Laure, Sanchez Wilfried, Amichot Marcel, Artigas Joan, Aviron Stéphanie, Barthélémy Carole, Beaudouin Rémy, Bedos Carole, Bérard Annette, Berny Philippe, Bertrand Cédric, Bertrand Colette, Betoulle Stéphane, Bureau-Point Ève, Charles Sandrine, Chaumot Arnaud, Chauvel Bruno, Coeurdassier Michael, Corio-Costet Marie-France, Coutellec Marie-Agnès, Crouzet Olivier, Doussan Isabelle, Fabure Juliette, Fritsch Clémentine, Gallai Nicola, Gonzalez Patrice, Gouy Véronique, Hedde Mickael, Langlais Alexandra, Le Bellec Fabrice, Leboulanger Christophe, Margoum Christelle, Martin-Laurent Fabrice, Mongruel Rémi, Morin Soizic, Mougin Christian, Munaron Dominique, Nélieu Sylvie, Pélosi Céline, Rault Magali, Sabater Sergi, Stachowski-Haberkorn Sabine, Sucré Elliott, Thomas Marielle, Tournebize Julien, Leenhardt Sophie (2023). Main conclusions and perspectives from the collective scientific assessment of the effects of plant protection products on biodiversity and ecosystem services along the land–sea continuum in France and French overseas territories. Environmental Science and Pollution Research, 2023, n.p. ⟨10.1007/s11356-023-26952-z⟩

Mamy Laure, Pesce Stéphane, Sanchez Wilfried, Aviron Stéphanie, Bedos Carole, Berny Philippe, Bertrand Colette, Betoulle Stéphane, Charles Sandrine, Chaumot Arnaud, Coeurdassier Michael, Coutellec Marie-Agnès, Crouzet Olivier, Fabure Juliette, Fritsch Clémentine, Gonzalez Patrice, Hedde Mickael, Leboulanger C, Margoum Christelle, Mougin Christian, Munaron Dominique, Nelieu Sylvie, Pelosi Céline, Rault Magali, Sucré Elliott, Thomas Marielle, Tournebize Julien, Leenhardt Sophie (2023). Impacts of neonicotinoids on biodiversity: a critical review. Environmental Science and Pollution Research, 2023, ⟨10.1007/s11356-023-31032-3⟩

Pesce Stéphane, Bérard Annette, Coutellec Marie-Agnès, Hedde Mickael, Langlais-Hesse Alexandra, Larras Floriane, Leenhardt Sophie, Mongruel Remi, Munaron Dominique, Sabater Sergi, Gallai Nicola (2023). Linking ecotoxicological effects on biodiversity and ecosystem functions to impairment of ecosystem services is a challenge: an illustration with the case of plant protection products. Environmental Science and Pollution Research, In press, ⟨10.1007/s11356-023-29128-x⟩

Kim Jiwan, Coutellec Marie-Agnès, Lee Sangkyu, Choi Jinhee (2023). Insights into the mechanisms of within-species variation in sensitivity to chemicals: A case study using daphnids exposed to CMIT/MIT biocide. Ecotoxicology and Environmental Safety, 2023, 258, pp.114967. ⟨10.1016/j.ecoenv.2023.114967⟩

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