BESNARD Anne-Laure
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Technician Theme(s) : Population dynamics, life history trait, Ecology
Trophic interaction
Address: UMR DECOD, 65 rue de Saint-Brieuc, Bât. 15, CS 84215, 35042 Rennes Cedex, France Keywords: Molecular biology, Microsatellite, Genotyping, NGS, PCR, qPCR, Environmental ADN, SNP  |
Expertise
- Molecular biology: PCR, quantitative PCR (qPCR), digital PCR (dPCR),
- DNA and environmental DNA
- Genotyping (microsatellite, SNP)
- Barcoding and metabarcoding
- Management of the UMR's molecular biology unit (development, provision, training and supervision of users)
Research
Current Research Topics
- Development of species detection tests using environmental DNA (qPCR and dPCR)
- Molecular characterization of life history traits (sexing, maturity in salmonids)
- Production of genotyping data of SNPs markers by amplicon sequencing (Hiplex)
- Production of data for the study of diets by metabarcoding
- Production of data for the study of aquatic diversity by barcoding or metabarcoding
Collaborations
o Technology platforms: EcoGeno (Rennes), Gentyane (Clermont-Ferrand), Génotoul (Toulouse)
o Other UMRs, laboratories and universities:
U3E experimentation unit for aquatic ecology and ecotoxicology U3E, INRAE Rennes University of Greifswald Research Unit IGEPP, INRAE Rennes Roscoff Biological Station, CNRS RoscoffResearch Unit ECOBIO, CNRS Rennes
Current projects
SELUNE Multidisciplinary study of the Selune river restoration following the removal of two large dams | Timeframe : 2012 - 2028 Keywords : Connectivité / Cycle de vie / Dynamique des populations / Ecologie spatiale / Fronts de colonisation / Habitats essentiels / Interactions trophiques / Invasions biologiques / Migration / Restauration / Barrages / Biofilms / Communautés / Dispersion / Ecosystèmes / Individus / Macroinvertébrés / Phytoplankton / Plantes / Poissons / Populations / ADNe / Analyses de séries temporelles / Biologging / Capture, échantillonnage et inventaire / Génétique quantitative / Hydroacoustique / Isotopes stables / Marquage-recapture / Télémétrie |
Genetic and physiological approach to assess the health status of ray populations | Timeframe : 2023 - 2026 Keywords : Dynamique des populations / Epigénétique / Multi-stress / Individus / Pêche / Poissons / Populations / Bio-informatique / Biomarqueurs et traceurs / Capture, échantillonnage et inventaire / Développement de scripts / Géomatique / Marquage-recapture / Modélisation statistique |
Combining environmental DNA sampling, whale watching and citizen science for stakeholder-driven marine biodiversity protection in the North-East Atlantic and the Mediterranean | Timeframe : 2023 - 2025 Keywords : Ecologie spatiale / Evaluation / Niche écologique / Individus / Mammifères / Poissons / Populations / ADNe / Modélisation statistique |
L’ADNe pour décrypter les interactions trophiques dans les forêts de laminaires de Bretagne | Timeframe : 2019 - 2024 Keywords : cascades trophiques / Interactions trophiques / Stabilité des réseaux / Stress abiotique / Communautés / Macroinvertébrés / Organes / Poissons / ADNe / Contenus stomacaux |
| Timeframe : 2021 - 2024 Keywords : cascades trophiques / Interactions trophiques / Stabilité des réseaux / Macroinvertébrés / Poissons / ADNe / Isotopes stables |
Salmonid Management Round the Channel | Timeframe : 2017 - 2023 Keywords : Cycle de vie / Dynamique des populations / Ecologie spatiale / Evaluation / Migration / Plasticité phénotypique / Traits d’histoire de vie / Traits phénotypiques / Age à maturité / Changement climatique / Dispersion / Fécondité / Individus / Poissons / Populations / Survie / Taille à maturité / Taux de croissance corporelle / Analyse de pièces calcifiées / Analyses de séries temporelles / Biomarqueurs et traceurs / Capteurs / Capture, échantillonnage et inventaire / Génétique quantitative / Hydroacoustique / Isotopes stables / Marquage-recapture / Modélisation mécaniste / Modélisation statistique / Statistiques multivariées |
Collective Services
- Responsible for the unit Molecular Biology activity
- Responsible for unit metrology
M.Sc. Students
TROUILLOT, L. (2023) Analyse d'ADN du contenu intestinal pour identifier la ségrégation des niches écologiques chez les espèces de poissons marins associées à l'écosystème de la forêt de laminaires en Bretagne
PICHEVIN, A. (2022) Relation entre la concentration d'ADNe dans l'eau et l'abandance/la biomasse des poissons marins : une étude pilote dans un aquarium public
MACEL, N. (2016) .Etude de la distribution spatiale de l'ecrevisse signal sur le bassin versant de la Selune : apport de l'ADN environnemental
GAIGHER, A. (2011) .Mesure du flux de genes entre populations de lamproie fluviatile et de lamproie de Planer. Memoire de 2eme annee Master Sciences De l'Univers, Environnement, Ecologie (SDUEE), Specialite Ecologie, Biodiversite, Evolution (EBE), UPMC-UPS-AgroParisTech- ENS
GAIGHER, A. (2010) .Mesure de l'isolement reproducteur entre la lamproie de Planer (Lampetra planeri et la lamproie fluviatile (Lampetra fluviatilis). Master 1 EBE, Universite de Paris 6. Co-encadrement avec E. Lasne
Ph.D. Students
DECANTER, N. (2023). Divergence génomique et spéciation entre la lamproie de rivière – parasite (Lampetra fluviatilis) et la lamproie de Planer – non-parasite (L. planeri)
TREHIN, C. (2022) .Reponse des populations de salmonides migrateurs aux changements globaux : Role de la croissance dans les strategies d?histoire de vie et la dynamique de population chez le saumon atlantique Salmo salar
DELORD, C. (2019) .Gestion des ressources halieutiques du Haut-Maroni : Impact de la pression de peche et des traits d?histoire de vie des especes sur la diversite genetique intra- et interpopulations
LEHNEN, L. (2018) .Drivers, prerequisites, and consequences of range expansion in Rhinolophus hipposideros
BELOUARD, N. (2018) .Coexistence d?especes dans des habitats discontinus. Le cas d?especes natives et invasives dans des reseaux de mares
MONTORIO, L. (2017) .Impact of global changes on life history, demography and populations dynamics in salmonids
JAN, P.-L. (2017) .Etude non invasive de la dynamique et de la genetique des populations chez une chauve-souris forestiere : impact de la qualite de l'habitat et de la connectivite
ROUGEMONT, Q. (2015) .Evolution de la divergence entre la lamproie fluviatile (Lampetra fluviatilis) et la lamproie de planer (L. planeri) inferee par des approches experimentales et de genomique des populations
Publications
Selection of Scientific Products
Tréhin Cécile, Rivot Etienne, Santanbien Valentin, Patin Rémi, Gregory Stephen, Lamireau Ludivine, Marchand Frédéric, Beaumont William, Scott Luke, Hillman Robert, Besnard Anne-Laure, Boisson Pierre‐yves, Meslier Lisa, King Andrew, Stevens Jamie, Nevoux Marie (2023). A multi‐population approach supports common patterns in marine growth and maturation decision in Atlantic salmon ( Salmo salar L.) from southern Europe. Journal of Fish Biology, 2023, pp.1-14. ⟨10.1111/jfb.15567⟩
Besnard Anne-Laure, Meslier Lisa, Jousseaume Thibaut, Nevoux Marie, Marchand Frederic, Launey Sophie (2023). Fast, safe and high-throughput Real-Time PCR protocol for molecular sex identification in Salmo salar, applicable to historic scale collections. 2023
Besnard Anne-Laure, Park Daniel J., J. Bernard, Hammet Fleur M.A., Michon-Coudouel Sophie, Biget Marine, Krueger-Hadfield Stacy A., Mauger Stéphane, Petit Eric J. (2023). Workflow for SNP genotyping using the Hi-Plex method v2. 2023
Souissi Ahmed, Besnard Anne-Laure, Evanno Guillaume (2023). Développement d'outils moléculaire pour l'identification des trois espèces de lamproie. Fiche synthèse, OFB; INRAE; Institut Agro; UPPA. 2023, 4 p
Besnard Anne-Laure, Lassalle Gilles, Michon-Coudouel Sophie, Stoeckel Solenn, Petit Eric J. (2022). Génotypage SNP : Protocole Hi-Plex2. Genomics, May 2022, Orléans, France
Souissi Ahmed, Besnard Anne-Laure, Evanno Guillaume (2022). Développement d’outils moléculaires pour l’identification et l'étude de la distribution des 3 espèces de lamproies à l'échelle nationale. OFB; Inrae; Institut Agro; UPPA. 2022, 17 p
Souissi Ahmed, Besnard Anne-Laure, Evanno Guillaume (2022). A SNP marker to discriminate the european brook lamprey (Lampetra planeri), river lamprey (L. fluviatilis) and their hybrids. Molecular Biology Reports, 2022, 49 (10), pp.10115-10119. ⟨10.1007/s11033-022-07800-8⟩
Rougemont Quentin, Perrier Charles, Besnard Anne-Laure, Lebel Isabelle, Abdallah Yann, Feunteun Eric, Réveillac Elodie, Lasne Emilien, Acou Anthony, Nachón David José, Cobo Fernando, Evanno Guillaume, Baglinière Jean-Luc, Launey Sophie (2022). Population genetics reveals divergent lineages and ongoing hybridization in a declining migratory fish species complex. Heredity, Nature Publishing Group, 2022, 129 (2), pp.137-151. ⟨10.1038/s41437-022-00547-9⟩
Lehnen Lisa, Jan Pierre-Loup, Besnard Anne‐laure, Fourcy Damien, Kerth Gerald, Biedermann Martin, Nyssen Pierrette, Schorcht Wigbert, Petit Eric, Puechmaille Sébastien (2021). Genetic diversity in a long‐lived mammal is explained by the past’s demographic shadow and current connectivity. Molecular Ecology, Wiley, 2021, 30 (20), pp.5048-5063. ⟨10.1111/mec.16123⟩
Rougemont Quentin, Dolo Victoria, Oger Adrien, Besnard Anne-Laure, Huteau Dominique, Coutellec Marie-Agnès, Perrier Charles, Launey Sophie, Evanno Guillaume (2021). Riverscape genetics in brook lamprey: genetic diversity is less influenced by river fragmentation than by gene flow with the anadromous ecotype. Heredity, Nature Publishing Group, 2021, 126 (2), pp.235-250. ⟨10.1038/s41437-020-00367-9⟩