FABRI-RUIZ Salomé
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Theme(s) : Spatial dynamics, connectivity, habitat and functional area
Ecosystems assessment and multiple anthrophic pressure
Address: IFREMER Keywords : Aire de répartition géographique / Ecologie spatiale / Epigénétique / Multi-stress / Niche écologique / Stress abiotique / Stress biotique / Traits d’histoire de vie / Changement climatique / Communautés / Poissons / Populations / ADNe / Développement de scripts / Modélisation individu-centrée / Modélisation mécaniste / Modélisation statistique / Statistiques multivariées |
Mes travaux de recherche s’intéressent à mieux comprendre ce qui contraint la distribution des espèces ainsi que de quantifier les impacts et effets des pressions anthropiques d'origine multiples sur les écosystèmes marins (changement climatique, EMR, pêche, etc). A cette fin, je développe des approches numériques de type statistique (modèle de niche écologique, modèles de communautés, ...) mais aussi mécanistiques comme les Dynamic Energy Budget Model. Je m'intéresse également au développement d'approches moléculaires (épigénétique) pour estimer l'âge biologique et chronologique d'espèces de raies et de poissons afin de les combiner à des marqueurs physiologiques pour quantifier leur état de stress. Je participe au déploiement de méthodes d'échantillonnage d'ADN environnementale.
Current projects
Genetic and physiological approach to assess the health status of ray populations | Timeframe : 2023 - 2026 Keywords : Dynamique des populations / Epigénétique / Multi-stress / Individus / Pêche / Poissons / Populations / Bio-informatique / Biomarqueurs et traceurs / Capture, échantillonnage et inventaire / Développement de scripts / Géomatique / Marquage-recapture / Modélisation statistique |
| Timeframe : 2024 - 2026 Keywords : Epigénétique / Habitats essentiels / Usages / Communautés / Poissons / Politiques publiques / Populations / Analyses de séries temporelles / Développement de scripts / Modélisation statistique / Statistiques multivariées |
Suivi des nourriceries côtières du parc naturel marin EGMP : Interprétation et analyse | Timeframe : 2023 - 2025 Keywords : Aire de répartition géographique / Cycle de vie / Ecologie spatiale / Habitats essentiels / Communautés / Poissons / Politiques publiques / Analyses de séries temporelles / Capture, échantillonnage et inventaire / Développement de scripts / Modélisation statistique |
Assessing the degradation of environmental RNA/DNA in controlled conditions for metabarcoding and ddPCR approaches. | Timeframe : 2023 - 2024 Keywords : Communautés / ADNe / Expérimentation ex-situ |
Expertise sur le suivi halieutique sur sites d'EMR
Expertise sur l'extraction de granulats
Expertise appui aux politiques publiques EMR
Publications
Selection of Scientific Products
ICES (2025). Working Group on Cumulative Effects Assessment Approaches in Management (WGCEAM; outputs from 2024 meeting) . ICES Scientific Reports/Rapports scientifiques du CIEM , 7(16), 51pp. https://doi.org/10.17895/ices.pub.28322693 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00935/104704/
ICES (2025). Working Group on Cumulative Effects Assessment Approaches in Management (WGCEAM; outputs from 2024 meeting) . ICES Scientific Reports/Rapports scientifiques du CIEM , 7(16), 51pp. Publisher's official version : https://doi.org/10.17895/ices.pub.28322693 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00935/104704/
Fabri-Ruiz Salome, Berdalet E., Ulses C., Somot S., Vila M., Lemée R., Irisson J.-O. (2024). Harmful Ostreopsis cf. ovata blooms could extend in time span with climate change in the Western Mediterranean Sea . Science Of The Total Environment , 947, 174726 (18p.) . https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2024.174726 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00899/101121/
Robert Alexandre, Grasso Florent, Fabri-Ruiz Salome, Vogel Camille, Bizzozero Lucie, Grouhel Anne, Amouroux Isabelle, Le Gall Yves, Simplet Laure (2024). Demande de contribution de l’Ifremer sur la demande d’autorisation environnementale du PER Granulats Marins Large Loire (2L) . DREAL Pays de la Loire - Direction Régionale de l'Environnement, de l'Aménagement et du Logement des Pays de la Loire, Service des risques naturels et technologiques, Division des risques naturels, hydrauliques et sous-sols, Nantes , Ref. Ifremer DG/2024-1238 _ P9-24-058 - Courriel du 24 juin 2024 avec saisine adressée via le guichet unique numérique de l’environnement , 9p.
Blanchet Aline, Fabri-Ruiz Salome, Régimbart Amélie, Simplet Laure (2024). Réponse de l'Ifremer à une demande d’avis sur le suivi environnemental quinquennal des concessions « Cairnstrath A et SN2 » . DREAL Pays de la Loire - Direction Régionale de l'Environnement, de l'Aménagement et du Logement des Pays de la Loire, Divison des risques naturels, hydrauliques et sous-sols, Nantes , Ref. Ifremer DG/2024-329 _ P9-23-097 - Courriel du 30 novembre 2023 et lettre de saisine jointe datée du 29 novembre 2023 (SRNT/2023-0847) , 17p.
Bernard Guillaume, Fabri-Ruiz Salome, Régimbart Amélie, Simplet Laure (2024). Demande d'avis de l'Ifremer sur le suivi environnemental quinquennal du Payré – Volets halieutique et bio-sédimentaire . DREAL Pays de la Loire - Direction Régionale de l'Environnement, de l'Aménagement et du Logement des Pays de la Loire, Service des risques naturels et technologiques, Division des risques naturels, hydrauliques et sous-sols, Nantes , Ref. Ifremer DG/2024-132 _ P9-23-099 - Courrier DREAL SRNT/2023-0846 du 30 novembre 2023 , 7p.
ICES (2024). Working Group on Offshore Renewable Energy (WGORE; outputs from 2023 meeting) . ICES Scientific Reports/Rapports scientifiques du CIEM , 6(69), 9p. https://doi.org/10.17895/ices.pub.26324926 . https://archimer.ifremer.fr/doc/00902/101348/
Le Corre Pauline (2024). Distribution modelling of benthic invertebrate biodiversity of the western European continental shelves and impact of climate changes . 5th-year Internship Report. INSA Lyon .
Fabri-Ruiz Salome, Berdalet E., Ulses C., Somot S., Vila M., Lemée R., Irisson J.-O. (2024). Harmful Ostreopsis cf. ovata blooms could extend in time span with climate change in the Western Mediterranean Sea . Science Of The Total Environment , 947, 174726 (18p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2024.174726 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00899/101121/
Robert Alexandre, Grasso Florent, Fabri-Ruiz Salome, Vogel Camille, Bizzozero Lucie, Grouhel Anne, Amouroux Isabelle, Le Gall Yves, Simplet Laure (2024). Demande de contribution de l’Ifremer sur la demande d’autorisation environnementale du PER Granulats Marins Large Loire (2L) . DREAL Pays de la Loire - Direction Régionale de l'Environnement, de l'Aménagement et du Logement des Pays de la Loire, Service des risques naturels et technologiques, Division des risques naturels, hydrauliques et sous-sols, Nantes , Ref. Ifremer DG/2024-1238 _ P9-24-058 - Courriel du 24 juin 2024 avec saisine adressée via le guichet unique numérique de l’environnement , 9p.