Staff

FABRI-RUIZ Salomé


Theme(s) :
Spatial dynamics, connectivity, habitat and functional area
Ecosystems assessment and multiple anthrophic pressure
Email : salome.fabri.ruiz@ifremer.fr
Address: IFREMER
Keywords : Aire de répartition géographique / Ecologie spatiale / Epigénétique / Multi-stress / Niche écologique / Stress abiotique / Stress biotique / Traits d’histoire de vie / Changement climatique / Communautés / Poissons / Populations / ADNe / Développement de scripts / Modélisation individu-centrée / Modélisation mécaniste / Modélisation statistique / Statistiques multivariées

Mes travaux de recherche s’intéressent à mieux comprendre ce qui contraint la distribution des espèces ainsi que de quantifier les impacts et effets des pressions anthropiques d'origine multiples sur les écosystèmes marins (changement climatique, EMR, pêche, etc). A cette fin, je développe des approches numériques de type statistique (modèle de niche écologique, modèles de communautés, ...) mais aussi mécanistiques comme les Dynamic Energy Budget Model. Je m'intéresse également au développement d'approches moléculaires (épigénétique) pour estimer l'âge biologique et chronologique d'espèces de raies et de poissons afin de les combiner à des marqueurs physiologiques pour quantifier leur état de stress. Je participe au déploiement de méthodes d'échantillonnage d'ADN environnementale. 

Current projects

Genetic and physiological approach to assess the health status of ray populations

AGEPPOP

Timeframe : 2023 - 2026
Keywords : Dynamique des populations / Epigénétique / Multi-stress / Individus / Pêche / Poissons / Populations / Bio-informatique / Biomarqueurs et traceurs / Capture, échantillonnage et inventaire / Développement de scripts / Géomatique / Marquage-recapture / Modélisation statistique

Suivi des nourriceries côtières du parc naturel marin EGMP : Interprétation et analyse

SUIVINOUR

Timeframe : 2023 - 2025
Keywords : Aire de répartition géographique / Cycle de vie / Ecologie spatiale / Habitats essentiels / Communautés / Poissons / Politiques publiques / Analyses de séries temporelles / Capture, échantillonnage et inventaire / Développement de scripts / Modélisation statistique

Assessing the degradation of environmental RNA/DNA in controlled conditions for metabarcoding and ddPCR approaches.

ERA

Timeframe : 2023 - 2024
Keywords : Communautés / ADNe / Expérimentation ex-situ

Past projects

Expertise sur le suivi halieutique sur  sites d'EMR

Expertise sur l'extraction de granulats

Expertise appui aux politiques publiques EMR

 

Publications

Selection of Scientific Products

Fabri-Ruiz Salome, Lorance Pascal (2023). Report of the AGEPPOP project survey in Noirmoutier - 2023 . RBE/HALGO/EMH .

Fabri-Ruiz Salome, Baudena A., Moullec Fabien, Lombard F., Irisson J.-O., Pedrotti M.L. (2023). Mistaking plastic for zooplankton: Risk assessment of plastic ingestion in the Mediterranean sea . Science Of The Total Environment , 856(Part.2), 159011 (11p.) . Publisher's official version : https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2022.159011 , Open Access version : https://archimer.ifremer.fr/doc/00795/90733/

Bernard Guillaume, Fabri-Ruiz Salome, Le Gac Solene, Ganthy Florian, Meteigner Claire, Antajan Elvire, Gouriou Laure, Grouhel Anne, Ponchart Marie, Le Gall Yves, Simplet Laure (2023). Réponse de l'Ifremer à la demande d'avis sur la prolongation de la validité du titre minier et des autorisations domaniales d’ouverture des travaux miniers et d’occupation temporaire du domaine public maritime de la concession minière de sables et de graviers siliceux marins dite « Platin de Grave » . DDTM 33 - Direction Départementale des Territoires et de la Mer de la Gironde, Service des Procédures Environnementales, Unité Prévention Pollutions et Nuisances, Bordeaux , Ref. Ifremer DG/2023-586 _ P9-23-014 - Courriel du 10 janvier 2023 et lettre de saisine jointe datée du 09 janvier 2023 , 17p.

Fabri-Ruiz Salome, Baudena A., Moullec Fabien, Lombard F., Irisson J.-O., Pedrotti M.L. (2023). Mistaking plastic for zooplankton: Risk assessment of plastic ingestion in the Mediterranean sea . Science Of The Total Environment , 856(Part.2), 159011 (11p.) . https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2022.159011

Carlier Antoine, Desroy Nicolas, Fabri-Ruiz Salome, Vogel Camille, Biseau Alain, Bacher Cedric, Ulrich Clara, Cuif Marion (2022). Analyse comparative des protocoles de réalisation des états de référence des suivis halieutiques et benthiques dans le cadre des autorisations des parcs éoliens en mer et de leurs raccordements . DGEC - Direction Générale de l'Energie et du Climat, Ministère de la Transition Energétique, Paris-La Défense , Ref. DG/2022.1675 - DGEC-SD3A-2022-0103 , 52p. https://archimer.ifremer.fr/doc/00834/94594/

Carlier Antoine, Desroy Nicolas, Fabri-Ruiz Salome, Vogel Camille, Biseau Alain, Bacher Cedric, Ulrich Clara, Cuif Marion (2022). Analyse comparative des protocoles de réalisation des états de référence des suivis halieutiques et benthiques dans le cadre des autorisations des parcs éoliens en mer et de leurs raccordements . DGEC - Direction Générale de l'Energie et du Climat, Ministère de la Transition Energétique, Paris-La Défense , Ref. DG/2022.1675 - DGEC-SD3A-2022-0103 , 52p.

Fabri-Ruiz Salome, Bernard Guillaume, Simplet Laure (2022). Réponse de l'Ifremer à une demande d’avis sur les rapports de suivi quinquennal 2017-2021 des concessions dites « Chassiron » . DREAL Nouvelle-Aquitaine - Direction Régionale de l’Environnement, de l’Aménagement et du Logement de Nouvelle‐Aquitaine, Service Environnement Industriel/DRC/Carrières et granulats marins, Poitiers , Ref. Ifremer DG/2022-1366 _ P9-22-053 - Courriel DREAL du 12 août 2022 , 10p.

Blanchet Aline, Verney Romaric, Le Gac Solene, Brind'Amour Anik, Fabri-Ruiz Salome, Bruneau Audrey, Deborde Jonathan, Simplet Laure (2022). Réponse de l'Ifremer aux demandes simultanées de prolongation de la validité des concessions dites « Chassiron B » et « Chassiron D », d'autorisation de travaux miniers et d'autorisation d'occupation temporaire du domaine public maritime . Préfecture de la Charente Maritime, Secrétariat Général, Direction de la coordination et de l’appui territorial, Bureau de l’Environnement, La Rochelle , Ref. Ifremer DG/2022-502 _ P9-22-018 - Courrier Préfecture du 13 décembre 2021 , 15p.

Fabri-Ruiz Salome, Guillaumot Charlene, Aguera Antonio, Danis Bruno, Saucede Thomas (2021). Using correlative and mechanistic niche models to assess the sensitivity of the Antarctic echinoid Sterechinus neumayeri to climate change . Polar Biology , 44(8), 1517-1539 . https://doi.org/10.1007/s00300-021-02886-5

Fabri-Ruiz Salome, Navarro N., Laffont R., Danis B., Saucede T. (2020). Diversity of Antarctic Echinoids and Ecoregions of the Southern Ocean . Biology Bulletin , 47(6), 683-698 . https://doi.org/10.1134/S1062359020060047

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