Équipe

Coutellec Marie-Agnès

Chargée de recherche
Thématique(s) :
Dynamique des population, cycles de vie, écologie et évolution
Aide à la décision pour la conservation, la restauration et la gestion durable des écosystèmes
Téléphone : +33 2 23 48 52 48 Email : marie-agnes.coutellec@inrae.fr
Adresse : UMR DECOD, 65 rue de Saint-Brieuc, Bât. 15, CS 84215, 35042 Rennes Cedex, France
Mots-clés : Dérive génétique / Epigénétique / Evaluation / Evolution adaptative / Multi-stress / Plasticité phénotypique / Sélection / Stress abiotique / Traits d’histoire de vie / Macroinvertébrés / Phytoplankton / Politiques publiques / Populations / Valeur sélective / Xénobiotiques / Zooplancton / ADNe / Bioindication / Biomarqueurs et traceurs / Common garden / Expérimentation ex-situ / Expérimentation in-situ / Génétique quantitative / Identification taxonomique / Sélection artificielle / Transcriptomique

Domaine d'expertise

Biologie évolutive et Ecotoxicologie

Fonctions actuelles

Chargée de recherche

Chargée de mission Ecotoxicologie, département AQUA

 

Recherche

Le cadre général de mes travaux actuels est celui de l’évolution des populations soumises à des perturbations environnementales d’origine anthropique, principalement chimique. Ces travaux portent en particulier sur i) la réponse de populations d’invertébrés d’eau douce exposées à divers micropolluants présents dans les agro-écosystèmes (pesticides et autres intrants), et sur ii) l’influence du système de reproduction sur la réponse et le devenir de ces populations.

L’objectif finalisé est de faire intégrer des concepts évolutifs indicateurs d’impact à long-terme (trans-générationnels et évolutifs) dans les procédures d’évaluation du risque écologique (ERA) mises en œuvre dans le cadre réglementaire.

 

Collaborations
  • CEFE, CNRS: P. David, P. Jarne
  • Genotoul Toulouse: O. Bouchez, N. Marsaud, C. Klopp, C. Noirot
  • INRAE UMR CARRTEL: A. Bouchez, F. Rimet
  • L. stagnalis genome sequencing international consortium. (Main partners: C Klopp, Génotoul Toulouse ; A Davison, Nottingham ; ZP Feng, Toronto; J Koene, Amsterdam; D Jackson, Göttingen).
  • Genoscope : A. Madoui, V. Barbe, B. Noël
  • CEA : J. Armengaud, C. Almunia
  • Jinhee Choi, Seoul University
  • Yumi Nakadera, Bielefeld University
  • University of Gent, Belgium : K. De Schamphelaere
  • CSIC, Barcelona, Spain: C. Barata

Projets en cours

Développement de ressources génomiques pour l’étude du potentiel évolutif des systèmes moléculaires de défense vis-à-vis du stress, chez un gastéropode d’eau douce, Lymnaea stagnalis

EGELYS

Période : 2010 -
Mots-clés : Genetic markers, Microsatellites, SNPs, transcriptomics, RNAseq, Lymnaea stagnalis.

Evolution face au stresse induite par les xénobiotiques

EVOTOXIS

Période : 2018 - 2021
Mots-clés : Daphnies, Ecotoxicologie, Stress oxydatif, Génomique fonctionnelle

DyNamiques écO-evolUtiVes en réponsE aux Activités hUmaines

NOUVEAU

Période : 2018 - 2021
Mots-clés : Evolution rapide, Expérimentations, Invasions biologiques, Pêcheries, Phénotypes, Réseaux trophiques

Projets archivés

Effets transgénérationnels de MIT dans les écosystèmes aquatiques

TrEMIT

Période : 2018 - 2020
Mots-clés : Daphnies, Ecotoxicologie, Génomique fonctionnelle, Epigénétique, Méthylisothiazolinone

Analyse moléculaire de la réponse à la sélection par le diquat chez un organisme hermaphrodite

PROTEOLYST

Période : 2017 - 2018
Mots-clés : Ecotoxicologie, Protéogénomique, Consanguinité, Exposition multigénération, Pesticides, <i>Lymnaea stagnalis</i>

Evolution de l’autofécondation chez les hermaphrodites : une perspective animale

ESHAP

Période : 2013 - 2016
Mots-clés : évolution des systèmes de reproduction, dépression de consanguinité, réponse à la sélection, stress environnemental

Propriétés et affinité de ligands de récepteurs aux perturbateurs endocriniens chez <i>Lymnaea stagnalis</i> (Mollusques, Gastéropodes)

PLAYLYST

Période : 2014 - 2016
Mots-clés : récepteur aux oestrogènes, récepteur X aux rétinoïdes, test <i>in vitro</i>, transfection cellulaire, prédiction <i>in silico</i>, modélisation du domaine de fixation des ligands

Utilisation de <i>Macrobrachium</i> spp. comme organisme sentinelle de la qualité des eaux de surface aux Antilles (Martinique et Guadeloupe)

MACROSENS

Période : 2013 - 2015
Mots-clés : biomonitoring, crevette, écotoxicologie tropicale, rivières, contaminants organiques, pesticides, biomarqueurs, neurotoxicité, génotoxicité, enzymes de biotransformation, perturbation endocrinienne, dynamique de populations, génétique de populations, phylogéographie

Polluo-sensibilité et Phylogénie

PHYLOTOX

Période : 2012 - 2015
Mots-clés : bioindication, signal phylogénétique, norme de réaction aux polluants, écosystèmes aquatiques

Etude du potentiel prédictif de biomarqueurs moléculaires

CREOLE

Période : 2011 - 2014
Mots-clés : évaluation du risque environnemental, pesticides, perturbateurs endocriniens, mollusques, crustacés, criblage, transcriptomique, protéomique, reprotoxicité, critère d'exclusion

Consulting Experience

 

 

Enseignement

  • 1999-2004 et 2006-2007: maître de conférences, Université Rennes 1 (biologie animale, biologie évolutive, biostatistiques).
  • 2007- 2017 : Ecotoxicologie (Master “Ingénierie environnementale” Agrocampus Ouest Rennes), Master “Ecologie-Toxicologie, Université d'Angers), Master EFCE (Université Rennes 1)

Encadrement d'étudiants

M.Sc. Students

Samuel Hermant (M1 IMABEE, Université Rennes1, 2020). Effet du mode de reproduction sur la réponse à la sélection pour l’autofécondation: test expérimental chez Lymnaea stagnalis ; coencadrement (50%) avec E. Edeline.

Nolwenn Decanter (M2 Biodiversité, Ecologie et Evolution, Université de Rennes1, 2018-2019). Mechanisms of sex determination in fishes. Coencadrement (20%) avec G. Evanno, A. Souissi et S. McCairns.

Fabien Cichonski (M1 Ecologie Fonctionnelle, Comportementale et Evolutive, Université Rennes1, 2017). Evaluation de méthodes d’étude des communautés microalgales d’eau douce : microscopie optique, spectrophotométrie et fluorimétrie. Coencadrement (50%) avec C. Gorzerino.

Marlène Bonnaud (M2 Ecologie Comportementale, Evolution, Biodiversité, Université de Tours, 2015-2016). Lien entre phylogénie et polluosensibilité chez les insectes aquatiques. Coencadrement (50%) avec F. Keck et A. Bouchez (UMR CARRTEL, Thonon-Les-Bains).

Adélaïde Duval (M1 EFCE Ecologie Fonctionnelle, Comportementale et Evolutive, Université Rennes1, 2015). Réponse à la sélection chez un organisme hermaphrodite : rôle de l’autofécondation chez Lymnaea stagnalis.

Victoria Dollo (M2 Biologie Moléculaire et Cellulaire, UPMC, 2013-2014). Impact des obstacles à la migration sur la structuration génétique de populations de lamproies de Planer et de lamproies fluviatiles. Coencadrement  (25%) avec G. Evanno, S. Launey et Q. Rougemont.

Valérie Lopez (M2 Ecologie Fonctionnelle, Comportementale et Evolutive, Université Rennes1, 2012-2013). Performances des hybrides truite-saumon face aux stress climatiques. Coencadrement (25%) avec G. Evanno, JM Roussel, et J. Côte.

Damien Choisne (M1 Bioinformatique, Université Rennes1, 2011). Contribution à l’analyse de données de séquençage de transcriptome chez un mollusque gastéropode d’eau douce, Lymnaea stagnalis, exposé à un herbicide.

 

Doctorants

Margot Wagner : Effets transgénérationnels du biocide CMIT/MIT sur une espèce clé de voûte des écosystèmes d’eau douce.  2019-2022. Coencadrement (50%) avec Scott McCairns.

Anthony Bouétard : « Potentiel évolutif des réponses transcriptomiques et phénotypiques vis-à-vis du stress d’origine anthropique : le case de Lymnaea stagnalis exposée aux pesticides ». 2009-2013. Contrat Jeune Scientifique (CJS-INRA).

Post-doctorants

Paul Boisseaux : Analyse moléculaire de la réponse à la sélection par le diquat chez un organisme hermaphrodite, approche protéo-génomique. 2018.

Audrey Chaput-Bardy : Dispersion et dynamique des populations chez  Macrobrachium spp. aux Antilles (MACROSENS-CMR). 2013-2015.

Activités collectives

Membre de l'équipe du département AQUA, chargée de mission écotoxicologie.

 

Etudiants en Master

HERMANT, S. .(2020) .Selection densite-dependante sur les taux d?autofecondation : test experimental chez la limnee des etangs

DECANTER, N. .(2019) .Identification de genes lies a la differenciation sexuelle chez les lamproies

BONNAUD, M. .(2016) .Phylogenie et polluosensibilite d'insectes aquatiques

DUVAL, A. .(2015) .Reponse a la selection chez un organisme hermaphrodite : role de l'autofecondation

DOLO, V. .(2014) .Impact des obstacles a la migration sur la structuration genetique des populations de lamproies de Planer (Lampetra planeri) et de lamproies fluviatiles (L. fluviatilis)

LOPEZ, V. .(2013) .Influence de l'environnement sur les performances des hybrides de saumon Atlantique et de truite commune

CHOISNE, D. .(2011) .Contribution a l?analyse de donnees de sequencage de transcriptome chez un mollusque gasteropode d?eau douce, Lymnaea stagnalis, expose a un herbicide. Master 1, Modelisation de systemes biologiques, Universite Rennes 1. Collaboration Genotoul, plateforme

Etudiants en Doctorat

BOUETARD, A. .(2013) .Potentiel evolutif des reponses transcriptomiques et phenotypiques vis-a-vis du stress d?origine anthropique : le cas de Lymnaea stagnalis exposee aux pesticides

WAGNER, M. .(en cours) .Effets transgenerationnels du biocide CMIT/MIT sur une espece cle de voute des eaux douce