COUTELLEC Marie-Agnès
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Chargée de recherche Thématique(s) : Dynamique des population, cycles de vie, écologie et évolution
Aide à la décision pour la conservation, la restauration et la gestion durable des écosystèmes
Adresse : UMR DECOD, 65 rue de Saint-Brieuc, Bât. 15, CS 84215, 35042 Rennes Cedex, France Mots-clés : Dérive génétique / Epigénétique / Evaluation / Evolution adaptative / Multi-stress / Plasticité phénotypique / Sélection / Stress abiotique / Traits d’histoire de vie / Macroinvertébrés / Phytoplankton / Politiques publiques / Populations / Valeur sélective / Xénobiotiques / Zooplancton / ADNe / Bioindication / Biomarqueurs et traceurs / Common garden / Expérimentation ex-situ / Expérimentation in-situ / Génétique quantitative / Identification taxonomique / Sélection artificielle / Transcriptomique  |
Domaine d'expertise
Biologie évolutive et Ecotoxicologie
Fonctions actuelles
Chargée de recherche
Chargée de mission Ecotoxicologie, département AQUA
Recherche
Le cadre général de mes travaux actuels est celui de l’évolution des populations soumises à des perturbations environnementales d’origine anthropique, principalement chimique. Ces travaux portent en particulier sur i) la réponse de populations d’invertébrés d’eau douce exposées à divers micropolluants présents dans les agro-écosystèmes (pesticides et autres intrants), et sur ii) l’influence du système de reproduction sur la réponse et le devenir de ces populations.
L’objectif finalisé est de faire intégrer des concepts évolutifs indicateurs d’impact à long-terme (trans-générationnels et évolutifs) dans les procédures d’évaluation du risque écologique (ERA) mises en œuvre dans le cadre réglementaire.
Collaborations
- CEFE, CNRS: P. David, P. Jarne
- Genotoul Toulouse: O. Bouchez, N. Marsaud, C. Klopp, C. Noirot
- INRAE UMR CARRTEL: A. Bouchez, F. Rimet
- L. stagnalis genome sequencing international consortium. (Main partners: C Klopp, Génotoul Toulouse ; A Davison, Nottingham ; ZP Feng, Toronto; J Koene, Amsterdam; D Jackson, Göttingen).
- Genoscope : A. Madoui, V. Barbe, B. Noël
- CEA : J. Armengaud, C. Almunia
- Jinhee Choi, Seoul University
- Yumi Nakadera, Bielefeld University
- University of Gent, Belgium : K. De Schamphelaere
- CSIC, Barcelona, Spain: C. Barata
Projets en cours
Développement de ressources génomiques pour l’étude du potentiel évolutif des systèmes moléculaires de défense vis-à-vis du stress, chez un gastéropode d’eau douce, Lymnaea stagnalis | Période : 2010 - Mots-clés : Genetic markers, Microsatellites, SNPs, transcriptomics, RNAseq, Lymnaea stagnalis. |
Consulting Experience
- Associate Editor of Ecotoxicology
- Editorial board member of KMAE (Knowledge and Management of Aquatic Ecosystems)
- Co-chair of EVO-GENERATE working group SETAC global advisory group ERA AG
Enseignement
- 1999-2004 et 2006-2007: maître de conférences, Université Rennes 1 (biologie animale, biologie évolutive, biostatistiques).
- 2007- 2017 : Ecotoxicologie (Master “Ingénierie environnementale” Agrocampus Ouest Rennes), Master “Ecologie-Toxicologie, Université d'Angers), Master EFCE (Université Rennes 1)
Encadrement d'étudiants
M.Sc. Students
Samuel Hermant (M1 IMABEE, Université Rennes1, 2020). Effet du mode de reproduction sur la réponse à la sélection pour l’autofécondation: test expérimental chez Lymnaea stagnalis ; coencadrement (50%) avec E. Edeline.
Nolwenn Decanter (M2 Biodiversité, Ecologie et Evolution, Université de Rennes1, 2018-2019). Mechanisms of sex determination in fishes. Coencadrement (20%) avec G. Evanno, A. Souissi et S. McCairns.
Fabien Cichonski (M1 Ecologie Fonctionnelle, Comportementale et Evolutive, Université Rennes1, 2017). Evaluation de méthodes d’étude des communautés microalgales d’eau douce : microscopie optique, spectrophotométrie et fluorimétrie. Coencadrement (50%) avec C. Gorzerino.
Marlène Bonnaud (M2 Ecologie Comportementale, Evolution, Biodiversité, Université de Tours, 2015-2016). Lien entre phylogénie et polluosensibilité chez les insectes aquatiques. Coencadrement (50%) avec F. Keck et A. Bouchez (UMR CARRTEL, Thonon-Les-Bains).
Adélaïde Duval (M1 EFCE Ecologie Fonctionnelle, Comportementale et Evolutive, Université Rennes1, 2015). Réponse à la sélection chez un organisme hermaphrodite : rôle de l’autofécondation chez Lymnaea stagnalis.
Victoria Dollo (M2 Biologie Moléculaire et Cellulaire, UPMC, 2013-2014). Impact des obstacles à la migration sur la structuration génétique de populations de lamproies de Planer et de lamproies fluviatiles. Coencadrement (25%) avec G. Evanno, S. Launey et Q. Rougemont.
Valérie Lopez (M2 Ecologie Fonctionnelle, Comportementale et Evolutive, Université Rennes1, 2012-2013). Performances des hybrides truite-saumon face aux stress climatiques. Coencadrement (25%) avec G. Evanno, JM Roussel, et J. Côte.
Damien Choisne (M1 Bioinformatique, Université Rennes1, 2011). Contribution à l’analyse de données de séquençage de transcriptome chez un mollusque gastéropode d’eau douce, Lymnaea stagnalis, exposé à un herbicide.
Doctorants
Margot Wagner : Effets transgénérationnels du biocide CMIT/MIT sur une espèce clé de voûte des écosystèmes d’eau douce. 2019-2022. Coencadrement (50%) avec Scott McCairns.
Anthony Bouétard : « Potentiel évolutif des réponses transcriptomiques et phénotypiques vis-à-vis du stress d’origine anthropique : le case de Lymnaea stagnalis exposée aux pesticides ». 2009-2013. Contrat Jeune Scientifique (CJS-INRA).
Post-doctorants
Paul Boisseaux : Analyse moléculaire de la réponse à la sélection par le diquat chez un organisme hermaphrodite, approche protéo-génomique. 2018.
Audrey Chaput-Bardy : Dispersion et dynamique des populations chez Macrobrachium spp. aux Antilles (MACROSENS-CMR). 2013-2015.
Activités collectives
Membre de l'équipe du département AQUA, chargée de mission écotoxicologie.
Etudiants en Master
HERMANT, S. (2020) .Selection densite-dependante sur les taux d?autofecondation : test experimental chez la limnee des etangs
DECANTER, N. (2019) .Identification de genes lies a la differenciation sexuelle chez les lamproies
BONNAUD, M. (2016) .Phylogenie et polluosensibilite d'insectes aquatiques
DUVAL, A. (2015) .Reponse a la selection chez un organisme hermaphrodite : role de l'autofecondation
DOLO, V. (2014) .Impact des obstacles a la migration sur la structuration genetique des populations de lamproies de Planer (Lampetra planeri) et de lamproies fluviatiles (L. fluviatilis)
LOPEZ, V. (2013) .Influence de l'environnement sur les performances des hybrides de saumon Atlantique et de truite commune
CHOISNE, D. (2011) .Contribution a l?analyse de donnees de sequencage de transcriptome chez un mollusque gasteropode d?eau douce, Lymnaea stagnalis, expose a un herbicide. Master 1, Modelisation de systemes biologiques, Universite Rennes 1. Collaboration Genotoul, plateforme
Etudiants en Doctorat
WAGNER, M. (2023). Toxicité de la méthylisothiazolinone sur l’espèce clé de voûte des écosystèmes d’eau douce Daphnia pulex
Publications
Sélection de publications
Mamy Laure, Pesce Stéphane, Betoulle Stéphane, Charles Sandrine, Coeurdassier Michaël, Coutellec Marie-Agnès, Leboulanger C, Martin-Laurent Fabrice, Mougin Christian, Nelieu Sylvie, Sucre Elliott, Leenhardt Sophie, Sanchez Wilfried (2025). Impacts of chlordecone on biodiversity: A review. Projet ANR LiCOCO – Workshop de mi-parcours, Apr 2025, Université des Antilles, Campus de Schoelcher, Martinique, France
Koene J., Jackson D., Nakadera Y., Cerveau N., Madoui M. -A., Noel B., Jamilloux V., Poulain J., Labadie K., da Silva C., Davison A., Feng Z. -P., Adema C., Klopp C., Aury J., Wincker P., Coutellec Marie-Agnès (2024). The genome of the simultaneously hermaphroditic snail Lymnaea stagnalis reveals an evolutionary expansion of FMRFamide-like receptors. Scientific Reports, 2024, 14 (1), pp.29213. ⟨10.1038/s41598-024-78520-1⟩
Sanchez Wilfried, Pesce Stéphane, Betoulle Stephane, Charles Sandrine, Coeurdassier Michaël, Coutellec Marie-Agnès, Leboulanger C, Martin-Laurent Fabrice, Mougin Christian, Nelieu Sylvie, Sucre Elliott, Leenhardt Sophie, Mamy Laure (2024). Chlordecone pollution and its effects on biodiversity: Knowledge gaps despite 15 years of public policy in the French West Indies. 2024
Allen Joey, Sire Marion, Belouard Nadège, Gorzerino Caroline, Coutellec Marie-Agnès, Mony Cendrine, Pannard Alexandrine, Piscart Christophe (2024). Could landscape ecology principles apply at the microscale? A metabarcoding approach on Trichoptera larvae-associated microbial diversity. Science of the Total Environment, 2024, 955, pp.177304. ⟨10.1016/j.scitotenv.2024.177304⟩
Coutellec Marie-Agnès (2024). Impacts des produits phytopharmaceutiques sur la biodiversité des milieux aquatiques : état des connaissances, lacunes et perspectives. Micropolluants organiques dans l'eau : des enjeux aux solutions, CEBEDEAU, Nov 2024, Liège, Belgium
Mamy Laure, Pesce Stéphane, Sanchez Wilfried, Aviron Stéphanie, Bedos Carole, Berny Philippe, Bertrand Colette, Betoulle Stephane, Charles Sandrine, Chaumot Arnaud, Coeurdassier Michael, Coutellec Marie-Agnès, Crouzet Olivier, Fabure Juliette, Fritsch Clémentine, Gonzalez Patrice, Hedde Mickael, Leboulanger C, Margoum Christelle, Mougin Christian, Munaron Dominique, Nelieu Sylvie, Pelosi Céline, Rault Magali, Sucre Elliott, Thomas Marielle, Tournebize Julien, Leenhardt Sophie (2024). Impacts des néonicotinoïdes sur la biodiversité. 52ème congrès du Groupe Français de recherche sur les Pesticides, INRAE; Groupe Français de recherche sur les Pesticides, May 2024, Lyon, France
Mamy Laure, Pesce Stéphane, Sanchez Wilfried, Aviron Stéphanie, Bedos Carole, Berny Philippe, Bertrand Colette, Betoulle Stephane, Charles Sandrine, Chaumot Arnaud, Coeurdassier Michael, Coutellec Marie-Agnès, Crouzet Olivier, Fabure Juliette, Fritsch Clémentine, Gonzalez Patrice, Hedde Mickael, Leboulanger C, Margoum Christelle, Mougin Christian, Munaron Dominique, Nelieu Sylvie, Pelosi Céline, Rault Magali, Sucre Elliott, Thomas Marielle, Tournebize Julien, Leenhardt Sophie (2024). Impacts des néonicotinoïdes sur la biodiversité. Séminaire EcoScience, INRAE UMR EcoSys, Apr 2024, Palaiseau, France
Pesce Stéphane, Mamy Laure, Sanchez Wilfried, Artigas Joan, Bérard Annette, Betoulle Stéphane, Chaumot Arnaud, Coutellec Marie-Agnès, Crouzet Olivier, Faburé Juliette, Hedde Mickael, Leboulanger Christophe, Margoum Christelle, Martin-Laurent Fabrice, Morin Soizic, Mougin Christian, Munaron Dominique, Nélieu Sylvie, Pelosi Céline, Leenhardt Sophie (2024). The use of copper as plant protection product contributes to environmental contamination and resulting impacts on terrestrial and aquatic biodiversity and ecosystem functions. Environmental Science and Pollution Research, In press, ⟨10.1007/s11356-024-32145-z⟩
Koene Joris, Jackson Daniel J., Nakadera Yumi, Cerveau Nicolas, Madoui Mohammed‐amin, Noel Benjamin, Jamilloux Véronique, Poulain Julie, Labadie Karine, Silva Corinne, Davison Angus, Feng Zhong-Ping, Adema Coen, Klopp Christophe, Aury Jean-Marc, Wincker Patrick, Coutellec Marie-Agnès (2024). The genome of the simultaneously hermaphroditic snail Lymnaea stagnalis reveals an evolutionary expansion of FMRFamide-like receptors. 2024