BESNARD Anne-Laure
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Assistante-Ingénieure Thématique(s) : Dynamique des population, cycles de vie, écologie et évolution
Interactions trophiques
Adresse : UMR DECOD, 65 rue de Saint-Brieuc, Bât. 15, CS 84215, 35042 Rennes Cedex, France Mots-clés : Interactions trophiques / Invasions biologiques / Traits d’histoire de vie / ADNe / Génomique / Métrologie / Transcriptomique  |
Compétences
- Biologie moléculaire : PCR, PCR quantitative (qPCR), PCR Digitale (dPCR),
- ADN et ADN environnemental
- Génotypage (microsatellite, SNP)
- Barcoding et metabarcoding
- Gestion du pôle de biologie moléculaire de l’UMR (développement, mise à disposition, formation et encadrement des utilisateurs)
Recherche
Thèmes de recherche actuels
- Développement de tests de détection d’espèce par les ADN environnementaux (qPCR et dPCR)
- Caractérisation moléculaire de traits d’histoire de vie (sexage, maturité chez les salmonidés)
- Production de données de génotypage de marqueurs SNPs par séquençage d’amplicons (Hiplex)
- Production de données pour l’étude des régimes alimentaires par métabarcoding
- Production de données pour l’étude de la diversité aquatique par barcoding ou métabarcoding
Collaborations
o Plateformes technologiques : EcoGeno (Rennes), Gentyane (Clermont-Ferrand), Génotoul (Toulouse)
o Autres UMR, laboratoires et universités : Unité Expérimentale d'Ecologie et Ecotoxicologie Aquatique U3E, INRAE Rennes, Université de Greifswald, Unité Mixte de Recherche IGEPP, INRAE Rennes, Station biologique de Roscoff, CNRS Roscoff, Unité Mixte de Recherche ECOBIO, CNRS Rennes
Projets en cours
Etude multidisciplinaire de la restauration du fleuve Sélune après l'effacement de deux grands barrages | Période : 2012 - 2028 Mots-clés : Connectivité / Cycle de vie / Dynamique des populations / Ecologie spatiale / Fronts de colonisation / Habitats essentiels / Interactions trophiques / Invasions biologiques / Migration / Restauration / Barrages / Biofilms / Communautés / Dispersion / Ecosystèmes / Individus / Macroinvertébrés / Phytoplankton / Plantes / Poissons / Populations / ADNe / Analyses de séries temporelles / Biologging / Capture, échantillonnage et inventaire / Génétique quantitative / Hydroacoustique / Isotopes stables / Marquage-recapture / Télémétrie |
Approche génétique et physiologique pour quantifier l’état de santé des populations de Raies | Période : 2023 - 2026 Mots-clés : Dynamique des populations / Epigénétique / Multi-stress / Individus / Pêche / Poissons / Populations / Bio-informatique / Biomarqueurs et traceurs / Capture, échantillonnage et inventaire / Développement de scripts / Géomatique / Marquage-recapture / Modélisation statistique |
Combining environmental DNA sampling, whale watching and citizen science for stakeholder-driven marine biodiversity protection in the North-East Atlantic and the Mediterranean | Période : 2023 - 2025 Mots-clés : Ecologie spatiale / Evaluation / Niche écologique / Individus / Mammifères / Poissons / Populations / ADNe / Modélisation statistique |
L’ADNe pour décrypter les interactions trophiques dans les forêts de laminaires de Bretagne | Période : 2019 - 2024 Mots-clés : cascades trophiques / Interactions trophiques / Stabilité des réseaux / Stress abiotique / Communautés / Macroinvertébrés / Organes / Poissons / ADNe / Contenus stomacaux |
Un référentiel trophique des poissons et macro-invertébrés des fleuves de Guyane | Période : 2021 - 2024 Mots-clés : cascades trophiques / Interactions trophiques / Stabilité des réseaux / Macroinvertébrés / Poissons / ADNe / Isotopes stables |
Salmonid Management Round the Channel | Période : 2017 - 2023 Mots-clés : Cycle de vie / Dynamique des populations / Ecologie spatiale / Evaluation / Migration / Plasticité phénotypique / Traits d’histoire de vie / Traits phénotypiques / Age à maturité / Changement climatique / Dispersion / Fécondité / Individus / Poissons / Populations / Survie / Taille à maturité / Taux de croissance corporelle / Analyse de pièces calcifiées / Analyses de séries temporelles / Biomarqueurs et traceurs / Capteurs / Capture, échantillonnage et inventaire / Génétique quantitative / Hydroacoustique / Isotopes stables / Marquage-recapture / Modélisation mécaniste / Modélisation statistique / Statistiques multivariées |
Activités collectives
- Responsable de l'activité Biologie moléculaire de l'UMR
- Référent Métrologie d'Unité (RMU)
Etudiants en Master
TROUILLOT, L. (2023) Analyse d'ADN du contenu intestinal pour identifier la ségrégation des niches écologiques chez les espèces de poissons marins associées à l'écosystème de la forêt de laminaires en Bretagne
PICHEVIN, A. (2022) Relation entre la concentration d'ADNe dans l'eau et l'abandance/la biomasse des poissons marins : une étude pilote dans un aquarium public
MACEL, N. (2016) .Etude de la distribution spatiale de l'ecrevisse signal sur le bassin versant de la Selune : apport de l'ADN environnemental
GAIGHER, A. (2011) .Mesure du flux de genes entre populations de lamproie fluviatile et de lamproie de Planer. Memoire de 2eme annee Master Sciences De l'Univers, Environnement, Ecologie (SDUEE), Specialite Ecologie, Biodiversite, Evolution (EBE), UPMC-UPS-AgroParisTech- ENS
GAIGHER, A. (2010) .Mesure de l'isolement reproducteur entre la lamproie de Planer (Lampetra planeri et la lamproie fluviatile (Lampetra fluviatilis). Master 1 EBE, Universite de Paris 6. Co-encadrement avec E. Lasne
Etudiants en Doctorat
DECANTER, N. (2023). Divergence génomique et spéciation entre la lamproie de rivière – parasite (Lampetra fluviatilis) et la lamproie de Planer – non-parasite (L. planeri)
TREHIN, C. (2022) .Reponse des populations de salmonides migrateurs aux changements globaux : Role de la croissance dans les strategies d?histoire de vie et la dynamique de population chez le saumon atlantique Salmo salar
DELORD, C. (2019) .Gestion des ressources halieutiques du Haut-Maroni : Impact de la pression de peche et des traits d?histoire de vie des especes sur la diversite genetique intra- et interpopulations
LEHNEN, L. (2018) .Drivers, prerequisites, and consequences of range expansion in Rhinolophus hipposideros
BELOUARD, N. (2018) .Coexistence d?especes dans des habitats discontinus. Le cas d?especes natives et invasives dans des reseaux de mares
MONTORIO, L. (2017) .Impact of global changes on life history, demography and populations dynamics in salmonids
JAN, P.-L. (2017) .Etude non invasive de la dynamique et de la genetique des populations chez une chauve-souris forestiere : impact de la qualite de l'habitat et de la connectivite
ROUGEMONT, Q. (2015) .Evolution de la divergence entre la lamproie fluviatile (Lampetra fluviatilis) et la lamproie de planer (L. planeri) inferee par des approches experimentales et de genomique des populations
Publications
Sélection de publications
Tréhin Cécile, Rivot Etienne, Santanbien Valentin, Patin Rémi, Gregory Stephen, Lamireau Ludivine, Marchand Frédéric, Beaumont William, Scott Luke, Hillman Robert, Besnard Anne-Laure, Boisson Pierre‐yves, Meslier Lisa, King Andrew, Stevens Jamie, Nevoux Marie (2023). A multi‐population approach supports common patterns in marine growth and maturation decision in Atlantic salmon ( Salmo salar L.) from southern Europe. Journal of Fish Biology, 2023, pp.1-14. ⟨10.1111/jfb.15567⟩
Besnard Anne-Laure, Meslier Lisa, Jousseaume Thibaut, Nevoux Marie, Marchand Frederic, Launey Sophie (2023). Fast, safe and high-throughput Real-Time PCR protocol for molecular sex identification in Salmo salar, applicable to historic scale collections. 2023
Besnard Anne-Laure, Park Daniel J., J. Bernard, Hammet Fleur M.A., Michon-Coudouel Sophie, Biget Marine, Krueger-Hadfield Stacy A., Mauger Stéphane, Petit Eric J. (2023). Workflow for SNP genotyping using the Hi-Plex method v2. 2023
Souissi Ahmed, Besnard Anne-Laure, Evanno Guillaume (2023). Développement d'outils moléculaire pour l'identification des trois espèces de lamproie. Fiche synthèse, OFB; INRAE; Institut Agro; UPPA. 2023, 4 p
Besnard Anne-Laure, Lassalle Gilles, Michon-Coudouel Sophie, Stoeckel Solenn, Petit Eric J. (2022). Génotypage SNP : Protocole Hi-Plex2. Genomics, May 2022, Orléans, France
Souissi Ahmed, Besnard Anne-Laure, Evanno Guillaume (2022). Développement d’outils moléculaires pour l’identification et l'étude de la distribution des 3 espèces de lamproies à l'échelle nationale. OFB; Inrae; Institut Agro; UPPA. 2022, 17 p
Souissi Ahmed, Besnard Anne-Laure, Evanno Guillaume (2022). A SNP marker to discriminate the european brook lamprey (Lampetra planeri), river lamprey (L. fluviatilis) and their hybrids. Molecular Biology Reports, 2022, 49 (10), pp.10115-10119. ⟨10.1007/s11033-022-07800-8⟩
Rougemont Quentin, Perrier Charles, Besnard Anne-Laure, Lebel Isabelle, Abdallah Yann, Feunteun Eric, Réveillac Elodie, Lasne Emilien, Acou Anthony, Nachón David José, Cobo Fernando, Evanno Guillaume, Baglinière Jean-Luc, Launey Sophie (2022). Population genetics reveals divergent lineages and ongoing hybridization in a declining migratory fish species complex. Heredity, Nature Publishing Group, 2022, 129 (2), pp.137-151. ⟨10.1038/s41437-022-00547-9⟩
Lehnen Lisa, Jan Pierre-Loup, Besnard Anne‐laure, Fourcy Damien, Kerth Gerald, Biedermann Martin, Nyssen Pierrette, Schorcht Wigbert, Petit Eric, Puechmaille Sébastien (2021). Genetic diversity in a long‐lived mammal is explained by the past’s demographic shadow and current connectivity. Molecular Ecology, Wiley, 2021, 30 (20), pp.5048-5063. ⟨10.1111/mec.16123⟩
Rougemont Quentin, Dolo Victoria, Oger Adrien, Besnard Anne-Laure, Huteau Dominique, Coutellec Marie-Agnès, Perrier Charles, Launey Sophie, Evanno Guillaume (2021). Riverscape genetics in brook lamprey: genetic diversity is less influenced by river fragmentation than by gene flow with the anadromous ecotype. Heredity, Nature Publishing Group, 2021, 126 (2), pp.235-250. ⟨10.1038/s41437-020-00367-9⟩